Suporte computacional: o Projeto VGDN

• Processo: 00/11799-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2001
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2005
• Área do conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Metodologia e Técnicas da Computação
• Pesquisador responsável: Marco Dimas Gubitoso
• Beneficiário: Marco Dimas Gubitoso
• Instituição Sede: Instituto de Matemática e Estatística (IME). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 03/07494-7 - Viral Genetic Diversity Network - VGDN, BP.TT; 01/00257-4 - Suporte computacional ao Projeto VGDN, BP.TT
• Assunto(s): Banco de dados Armazenamento e recuperação da informação Filogenia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Alto Desempenho | Banco De Dados | Filogenia | Sequenciamento

Resumo

O projeto de destina ao desenvolvimento do suporte computacional para o projeto VGDN e consiste basicamente de três frentes: 1. Sistema de banco de dados: armazenamento dos dados clínicos e de seqüências, capacidade de integração das ferramentas de análise. 2. Otimização e paralelização dos programas de análise e filogenia utilizados e desenvolvimento de ferramentas auxiliares para estas aplicações. 3. Desenvolvimento de algoritmos específicos de análise de seqüências. As versões otimizadas dos programas, as ferramentas e as implementações dos algoritmos serão integradas ao banco de dados em uma etapa posterior do projeto. (AU)