Estudo da diversidade genética e de métodos moleculares de identificação de micobactérias isoladas em laboratórios públicos do estado de São Paulo

• Processo: 01/13389-6
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2003
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2005
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Lucilaine Ferrazoli
• Beneficiário: Lucilaine Ferrazoli
• Instituição Sede: Instituto Adolfo Lutz (IAL). Coordenadoria de Controle de Doenças (CCD). Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Identificação de bactérias Micobactérias atípicas Análise de sequência de DNA Diversidade genética Reação em cadeia por polimerase (PCR) Laboratórios
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Identificacao | Micobacterias | Pcr Restriction Analysis | Sequenciamento

Resumo

A identificação correta das micobactérias não tuberculosas (NTMs) é muito importante devido à variação destas quanto à patogenicidade e susceptibilidade a drogas. Os testes fenotípicos convencionais foram padronizados somente para identificar as NTMs mais frequentemente encontradas em isolados clínicos. A utilização de métodos moleculares poderá ser muito útil, pois além de reduzir o tempo para a identificação, permitirá a identificação de um número maior de espécies. O objetivo deste projeto será analisar amostras de NTMs para conhecer a diversidade genética das cepas isoladas em nosso meio e estabelecer um algoritmo de identificação adequado para a nossa realidade. Diferentes genes serão amplificados por PCR e digeridos e os padrões obtidos serão comparados com seus respectivos algoritmos para estabelecer a espécie. A diversidade genética será estabelecida com base no sequenciamento. Um banco de dados será construído com as sequências das NTMs possibilitando novos experimentos que caracterizem melhor estas espécies. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

CHIMARA‚ E.; FERRAZOLI‚ L.; UEKY‚ S.; MARTINS‚ M.; DURHAM‚ A.; ARBEIT‚ R.; LEÃO‚ S.. Reliable identification of mycobacterial species by PCR-restriction enzyme analysis (PRA)-hsp65 in a reference laboratory and elaboration of a sequence-based extended algorithm of PRA-hsp65 patterns. BMC Microbiology, v. 8, n. 1, p. 48, 2008. (01/13389-6)