Localizacao subcelular de proteinas de cana-de-acucar (saccharum spp.): caracterizacao in silico e avaliacao funcional em larga escala.

• Processo: 05/58104-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2006
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2008
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Marcelo Menossi Teixeira
• Beneficiário: Marcelo Menossi Teixeira
• Instituição Sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Município da Instituição Sede: Campinas
• Assunto(s): Cana-de-açúcar Genômica funcional Protoplastos Sacarose
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cana-De-Acucar | Genoma Funcional | Localizacao Subcelular | Protoplastos | Sacarose

Resumo

A caracterização funcional dos genes descobertos no projeto EST da cana-de-açúcar é um grande desafio. A identificação da localização subcelular das proteínas contribuiria nesse sentido, pois a localização determina potenciais padrões de interação metabólica. Nosso grupo, em colaboração com outras equipes, identificou genes com expressão associada à síntese e à acumulação de açúcar em folhas e entrenós, e genes que apresentam expressão constitutiva ou tecido preferencial. O principal objetivo deste projeto é ampliar o estudo funcional de genes de cana-de-açúcar através do estabelecimento de uma rotina para a determinação da localização subcelular de suas proteínas. Para tal serão utilizados métodos de bioinformática para predição in sílica e experimentos de expressão transiente de proteínas fusionadas com a proteína GFP (green fluorescent protein) em células de cana-de-açúcar ou de cebola. A localização subcelular será correlacionada com diversos dados funcionais, ampliando o conhecimento sobre importantes processos da cana-de-açúcar. (AU)

Publicações científicas

(5)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

VICENTINI, RENATO; MENOSSI, MARCELO. TISs-ST: a web server to evaluate polymorphic translation initiation sites and their reflections on the secretory targets. BMC Bioinformatics, v. 8, p. 0-0, May 2007. (03/07244-0, 02/01167-1, 05/58104-0)

PAPINI-TERZI, FLAVIA S.; ROCHA, FLAVIA R.; VENCIO, RICARDO Z. N.; FELIX, JULIANA M.; BRANCO, DIANA S.; WACLAWOVSKY, ALESSANDRO J.; DEL BEM, LUIZ E. V.; LEMBKE, CAROLINA G.; COSTA, MAXIMILLER D. L.; NISHIYAMA, JR., MILTON Y.; et al. Sugarcane genes associated with sucrose content. BMC Genomics, v. 10, p. 0-0, Mar. 2009. (05/58104-0, 02/01722-5)

VICENTINI, RENATO; MENOSSI, MARCELO. The predicted subcellular localisation of the sugarcane proteome. FUNCTIONAL PLANT BIOLOGY, v. 36, n. 3, p. 242-250, 2009. (05/58104-0)

VICENTINI, RENATO; FELIX, JULIANA DE MARIA; DORNELAS, MARCELO CARNIER; MENOSSI, MARCELO. Characterization of a sugarcane (Saccharum spp.) gene homolog to the brassinosteroid insensitive1-associated receptor kinase 1 that is associated to sugar content. Plant Cell Reports, v. 28, n. 3, p. 481-491, MAR 2009. (05/58104-0)

GENTILE, AGUSTINA; DA CRUZ, PEDRO; TAVARES, RAFAEL G.; KRUG-BALDACIN, MARIA GRAZIELA; MENOSSI, MARCELO. Molecular characterization of ScTFIIA gamma, encoding the putative TFIIA small subunit from sugarcane. Plant Cell Reports, v. 29, n. 8, p. 857-864, AUG 2010. (05/58104-0, 01/07546-1)