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Bioinformática aplicada à Biologia Sistêmica para a identificação dos fatores regulatórios do acúmulo de sacarose no colmo da cana-de-açúcar

Processo: 12/12521-2
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de julho de 2012
Vigência (Término): 31 de maio de 2016
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Carlos Alberto Labate
Beneficiário:Fabrício Edgar de Moraes
Instituição-sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:08/56100-5 - Metabolomics of sugarcane and discovery of new hydrolytic enzymes for biofuel production, AP.BIOEN.TEM
Assunto(s):Espectrometria de massas   Biologia computacional   Redes bayesianas   Proteômica   Metabolômica

Resumo

A cana-de-açúcar (Saccharum spp.) é uma das gramíneas cultivadas mais importantes do mundo e o Brasil é seu maior produtor, que tem como seu principal representante o estado de São Paulo concentrando mais da metade da área destinada a esta cultura. Com isso, faz-se necessário uma alta compreensão dos mecanismos que regulam o acúmulo de sacarose nesta planta. Os mecanismos genéticos que controlam o acúmulo de sacarose na cana de açúcar têm sido estudados em vários níveis, tais como, identificação e localização de genes, identificação de lócus controladores de características quantitativas, transcriptoma, proteoma, caracterização e identificação de metabólitos. Com todos esses estudos é evidente a necessidade de uma abordagem holística para o entendimento global da planta durante o acúmulo de sacarose. Assim este trabalho tem por objetivo caracterizar os metabólitos e as proteínas durante o desenvolvimento da planta e o acúmulo de sacarose, utilizando a bioinformática para unir esses resultados por meio de redes bayesianas em uma abordagem de biologia sistêmica. Assim será possível a construção de uma rede de regulação gênica, identificação de novas funções dos genes, vias metabólicas e fenótipos relacionados ao acúmulo de sacarose em cana-de-açúcar. Todas as informações geradas neste projeto serão integradas aos servidores do SUCEST-FUN (http://sucest-fun.org/) permitindo aos usuários um crosslink entre os dados de transcriptômica, metabolômica, proteômica, marcadores moleculares (como QTLs e E-QTLs) ou qualquer outro serviço disponível no servidor.