Construção de um banco de dados proteo-genômico de Mycobacterium turbeculosis

• Processo: 08/03003-2
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Pesquisa Inovativa em Pequenas Empresas - PIPE
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2009
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2009
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas
• Pesquisador responsável: Sandra Rodrigues Pereira Faça
• Beneficiário: Sandra Rodrigues Pereira Faça
• Empresa: Veritas Biotecnologia Ltda
• Município: Ribeirão Preto
• Pesquisadores associados: Celio Lopes Silva ; Daniela Maria Tomazela ; Fabio Cícero de Sá Galetti ; Vitor Marcel Faça
• Bolsa(s) vinculada(s): 09/50788-8 - Construção de um banco de dados proteo-genômico de Mycobacterium tuberculosis, BP.PIPE
• Assunto(s): Biomarcadores Espectrometria de massas Mycobacterium tuberculosis
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Anotacao Proteo Genomica | Biomarcadores | Espectrometria De Massas | Fracionamento De Proteinas | Mycobacterium Tuberculosis | Proteoma | Proteômica/Proteo-Genômica

Resumo

O genoma completo da linhagem H37Rv de Mycobacterium tuberculosis contém cerca de 4.500 genes e 3.924 "open reading frames" (ORFs) preditos. Entretando, o complemento funcional dessa informação genética, que é o proteoma, está longe de ser inteiramente elucidado. A relação estrutura-função, abundância e modificações pós-traducionais das proteínas, que não podem ser preditas somente pela sequência de DNA, são de importância fundamental para um melhor entendimento dos mecanismos patogênicos desse organismo e para o desenvolvimento de novas terapias e métodos de diagnóstico para a tuberculose (TB). O presente projeto pretende extender o nível de cobertura proteômica e a qualidade de anotação proteo-genômica da linhagem virulenta H37Rv de M. Tuberculosis (cultivada em condições aeróbicas e anaeróbicas), através de uma estratégia baseada em fracionamento de proteínas (secretadas, solúveis e aquelas de difícil solubilização) e análise por LC-MS/MS. Esse conjunto abrangente de dados das proteínas expressas pelo bacilo nos permitirá anotar os ORFs preditos a partir da sequência do DNA, bem como identificar possíveis variantes decorrentes de "splicing" alternativo e sítios de modificações pós-traducionais que ocorrem nestas proteínas. O banco de dados, produto da análise proteo-genômica, será a base das etapas seguintes de pesquisa de nossa empresa, que visa a descoberta de novas proteínas biomarcadoras para o diagnóstico e terapia da TB, tendo ainda potencial valor comercial por ser útil também à outras instituições privadas focadas nessa doença. Este projeto faz parte de uma parceria entre duas empresas - a VERITAS Life Sciences e a FARMACORE Biotecnologia Ltda - que atuam em pesquisa, desenvolvimento e inovação na área de doenças negligenciadas. Esta colaboração une pesquisadores experientes das áreas de proteômica e tuberculose, o que garante alcançar os objetivos acima apresentados. (AU)