Caracterização genética e das pressões seletivas atuantes na região do envelope e das variantes GWGR do subtipo B brasileiro

• Processo: 06/53818-7
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2006
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2008
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina
• Pesquisador responsável: Luiz Mário Ramos Janini
• Beneficiário: Luiz Mário Ramos Janini
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Análise de sequência de DNA Proteínas do envelope viral Produtos do gene env HIV AIDS
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Alca V3 | Envelope | Gpgr | Gwgr | Hiv Aids | Subtipo

Resumo

Cerca de 50% das variantes do subtipo B circulante no Brasil formam um agrupamento genético e antigênico distinto. Essa variante possui como característica a codificação da sequência de aminoácidos GWGR (ao invés do comum GPGR) na coroa da alça V3. A diferença em relação a esses aminoácidos sugerem que os isolados virais podem diferir em suas propriedades biológicas. Atualmente, não se sabe se as amostras GWGR são uma linhagem distinta ou apenas variantes de topo da alça V3 do env, pois o env é muito variável e possui sinal filogenético grande. Dessa forma, dados gerados a partir do sequenciamento da região env do HIV-1 funcionam como um excelente banco de informações que permitem um melhor entendimento da epidemia HIV/AIDS no Brasil. A utilização de metodologias menos sensíveis que são baseadas na análise de fragmentos menores pode, eventualmente, apresentar artefatos que superestimem os resultados encontrados. (AU)