Desenvolvimento de um microarranjo baseado na sequencia 16s rdna para determinacao da diversidade microbiana.

• Processo: 06/57134-5
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2007
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2009
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Aline Aparecida Pizzirani-Kleiner
• Beneficiário: Aline Aparecida Pizzirani-Kleiner
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Solos Impacto Microarranjo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Diversidade Bacteriana | Impactos | Microarranjo | Solos | 16S Rdna

Resumo

O desenvolvimento de técnicas, baseadas na análise do rRNA e rDNA, tem permitido o melhor conhecimento da diversidade microbiana. Esta análise tem possibilitado a identificação de novas espécies bacterianas, potenciais para biorremediação e também indicadores de qualidade ou impacto nos solos, como por exemplo, a presença de poluentes e plantas transgênicas. Em todas estas aplicações, as metodologias empregadas, ou traduzem "fingerprints" das comunidades, sem a possibilidade dé identificação de indivíduos, ou são muito trabalhosas e demoradas, como no caso das técnicas que envolvem seqüenciamento. Um método alternativo seria a utilização da tecnologia de microarranjos de DNA. Este projeto tem como objetivo, desenvolver um microarranjo com especificidade para seqüências do gene 16S rDNA, que permita determinar a diversidade bacteriana incluindo espécies não-cultiváveis, bem como o diagnóstico dos efeitos em diferentes ambientes, podendo gerar um produto biotecnológico aplicável e interessante para a análise de diversidade microbiana (AU)