Métodos combinatórios para o cálculo de estruturas de proteínas através de dados de RMN

• Processo: 09/05470-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2009
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2011
• Área do conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Matemática da Computação
• Pesquisador responsável: Carlile Campos Lavor
• Beneficiário: Carlile Campos Lavor
• Instituição Sede: Instituto de Matemática, Estatística e Computação Científica (IMECC). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Geometria combinatória Ressonância magnética nuclear Estrutura molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Geometria Molecular | métodos combinatórios | Ressonância Magnética Nuclear | Otimização de geometria molecular

Resumo

Este projeto está relacionado ao projeto "Cálculo de estruturas de proteínas através de dados de ressonância magnética nuclear (RMN)", concedido pela FAPESP (2007/07230-0) em 2007 e com vigência de 01/02/2008 a 31/01/2009. Nosso objetivo é dar continuidade à pesquisa já iniciada, considerando os novos problemas e soluções apontados pelo projeto anterior. Diferentemente dos métodos tradicionais aplicados ao cálculo de estruturas de proteínas através de dados de RMN (baseados em otimização contínua), onde a obtenção de apenas uma solução do problema já apresenta grandes dificuldades computacionais, iremos desenvolver novos métodos baseados numa abordagem combinatória, cujos resultados associados ao projeto anterior indicam que essa abordagem é o início de uma nova linha de pesquisa inédita e promissora. Uma das vantagens dessa nova abordagem é a possibilidade de encontrar não apenas uma, mas múltiplas soluções para o problema (fato já detectado em resultados experimentais). Além dessa questão, investigaremos a aplicação dos novos métodos em problemas reais, que serão obtidos através de uma colaboração já iniciada com o Centro Nacional de Ressonância Magnética Nuclear da UFRJ. É importante destacar que os resultados da literatura sobre o problema em questão não resolvem de fato o problema, pois os experimentos computacionais são realizados com estruturas de proteínas já conhecidas, onde as instâncias para o problema são produzidas artificialmente, baseadas justamente nessas estruturas. Pelo caráter multidisciplinar dessa proposta, contaremos com a colaboração de pesquisadores de outras áreas e instituições, tais como École Polytechnique de Paris, Western Kentucky University, UFRJ, UFF e EMBRAPA. (AU)