Cálculo de estruturas de proteínas através de dados de ressonância magnética nuclear

• Processo: 07/07230-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2008
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2009
• Área do conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Matemática da Computação
• Pesquisador responsável: Carlile Campos Lavor
• Beneficiário: Carlile Campos Lavor
• Instituição Sede: Instituto de Matemática, Estatística e Computação Científica (IMECC). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Estrutura molecular Algoritmos Otimização global
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: aritmética intervalar | Geometria Molecular | otimização global | Ressonância Magnética Nuclear | Otimização de geometria molecular

Resumo

O conhecimento da estrutura tridimensional de uma molécula é fundamental para entender suas propriedades físico-químicas. Neste projeto, iremos desenvolver algoritmos para o cálculo de estruturas de proteínas, utilizando distâncias entre pares de átomos obtidas através de experimentos de ressonância magnética nuclear. Modelando este problema como um problema de otimização, a grande dificuldade é a existência de vários mínimos locais, onde se deseja encontrar o menor deles: o mínimo global. A maior parte dos métodos de otimização global é de natureza estocástica ou heurística, e, portanto, não garantem que o mínimo global é encontrado. Nossa proposta é desenvolver métodos que encontrem, de fato, o mínimo global do problema. (AU)