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Mecanismos moleculars fundamentais responsaveis pela complexacao de proteinas. de parametros fisico-quimicos as aplicacoes em tecnologia de alimentos e farmaceutica.

Resumo

As interações eletrostáticas em e entre biomoléculas desempenham um importante papel no entendimento e no controle do comportamento de proteínas e de misturas de biopolímeros, incluindo vários sistemas de considerável relevância, tanto nas ciências da vida, como em (bio)tecnologia. Nesta proposta, pretendemos estudar (a) o efeito do mecanismo da regulação de cargas no aumento das demais interações eletrostáticas responsáveis pela complexação de proteínas, (b) aspectos eletrostaticos da interação proteína-polieletrólitos (e.g. interação caseina-pectina) e proteína-proteína (e.g. b-LG-b-LG). Nossa ferramenta básica de trabalho será a Mecânica Estatística (simulações moleculares), complementada com investigações em colaboração com grupos experimentais. O principal resultado final será a energia livre das interações (e suas derivadas). A modelagem dos sistemas será baseada em modelos contínuos anteriormente desenvolvidos por nós, cujas Hamiltonianas efetivas serão solucionadas por simulações com o método Monte Cario em conjunto com técnicas de perturbação termodinâmicas e algoritmos que serão desenvolvidos para facilitar a amostragem do espaço de fases. Pretende-se também revisar aspectos metodológicos, aprimorar e desenvolver novas ferramentas computacionais. (AU)

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Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
BARROSO DA SILVA, FERNANDO LUIS; DERREUMAUX, PHILIPPE; PASQUALI, SAMUELA. Fast coarse-grained model for RNA titration. Journal of Chemical Physics, v. 146, n. 3 JAN 21 2017. Citações Web of Science: 6.
DELBONI, LARIANI APARECIDA; BARROSO DA SILVA, FERNANDO LUIS. On the complexation of whey proteins. FOOD HYDROCOLLOIDS, v. 55, p. 89-99, APR 2016. Citações Web of Science: 11.
BARROSO DA SILVA, FERNANDO LUIS; PASQUALI, SAMUELA; DERREUMAUX, PHILIPPE; DIAS, LUIS GUSTAVO. Electrostatics analysis of the mutational and pH effects of the N-terminal domain self-association of the major ampullate spidroin. SOFT MATTER, v. 12, n. 25, p. 5600-5612, 2016. Citações Web of Science: 10.
BARROSO DA SILVA, FERNANDO LUIS; BOSTROM, MATHIAS; PERSSON, CLAS. Effect of Charge Regulation and Ion-Dipole Interactions on the Selectivity of Protein-Nanoparticle Binding. Langmuir, v. 30, n. 14, p. 4078-4083, APR 15 2014. Citações Web of Science: 20.

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