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An Integrated Molecular Map of Yellow Passion Fruit Based on Simultaneous Maximum-likelihood Estimation of Linkage and Linkage Phases

Processo: 08/03491-7
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
Vigência: 01 de maio de 2008 - 31 de outubro de 2008
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
Pesquisador responsável:Maria Lúcia Carneiro Vieira
Beneficiário:Maria Lúcia Carneiro Vieira
Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Assunto(s):Marcadores genéticos  Mapeamento  Mapeamento genético  Passiflora 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Mapas de ligação | Mapeamento | Marcadores Genéticos | Passiflora | Mapeamento Genético

Resumo

O desenvolvimento de mapas genéticos para espécies auto-incompatíveis, como o maracujá-amarelo (Passiflora edulis Sims f. flavicarpa Deg.) é restrito dada à dificuldade de se gerar populações de mapeamento baseadas em linhagens endogâmicas. Por conseqüência, a construção de mapas de ligação em maracujá-amarelo tem sido feita pela estratégia duplo pseudocruzamento teste, baseada na segregação de marcas monoparentais e dominantes (1:1). Devido à falta de informação sobre estas marcas em um dos pais, mapas individuais para cada genitor do cruzamento foram gerados. A integração desses mapas é possível com base em marcadores bi-parentais. O objetivo deste estudo foi construir um mapa molecular integrado para uma população de irmãos-germanos combinando locos de diferentes configurações, a partir de polimorfismos de AFLP e microssatélites, utilizando um algoritmo que estima, simultaneamente, a fase de ligação e a freqüência de recombinação. Dentre o total de locos, 76%, 21%, 0,7%, e 2,3% segregaram na proporção de 1:1, 3:1, 1:2:1, e 1:1:1:1, respectivamente. Foram obtidos 10 grupos de ligação (GL) com LOD maior que 5,0 assumindo uma fração de recombinação menor que 0,35. Foram obtidos, em média, 24 marcadores por GL, que forneceram um comprimento de mapa de 1687 cM. Nenhuma marca foi alocada como acessória como ocorreu nos mapas individuais anteriormente construídos. (AU)

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