Identificação molecular de enterobactérias isoladas de cana-de-açúcar pelos genes gyrB, rpoB e 16SrRNA

• Processo: 11/01941-8
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2011
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2012
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia
• Pesquisador responsável: Heloiza Ramos Barbosa
• Beneficiário: Heloiza Ramos Barbosa
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Felipe Ibañez de Santi Ferrara ; Simone Ichiwaki
• Assunto(s): Enterobacteriaceae
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: cana-de-açúcar | enterobacteriaceae | gyrB | identificação molecular | rpoB | 16S rRNA | Biologia molecular

Resumo

A identificação molecular de determinados grupos bacterianos, como as enterobactérias, através do sequenciamento do gene 16S rRNA pode levar a resultados imprecisos. Hoje aceita-se uma identidade maior que 98,7% do 16S rRNA, como limite mínimo para diferenciar espécies pois, na maioria dos casos, essa similaridade correspode a uma identidade DNA-DNA maior de 70%. No entanto, no caso das enterobactérias, os genes 16S rRNA de bactérias pertencentesa gêneros diferentes apresentam similaridades maiores que os 98,7%. Projetos anteriores desenvolvidos em nosso laboratório apontaram a presença de grande quantidade de enterobactérias em rizosfera e endofíticas de cana-de-açúcar. Essas bactérias apresentaram grande produção de fitormônios (AIA e etileno), enzimas (pectinase, endoglicanase e nitrato redutase) e compostos nitrogenados (aminoácidos e poliaminas). O uso de alguns desses microrganismos em associações com células vegetais mostrou aumento de proteína vegetal. Diante das grandes potencialidades desses microrganismos é de fundamental importância a precisa identificação das enterobactérias. (AU)