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Análise dos transcritos de miRNAs, REX e tax em células T no curso da infecção pelo HTLV-1, utilizando sequenciamento de nova geração

Processo: 11/12297-2
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de abril de 2012 - 30 de setembro de 2014
Área do conhecimento:Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
Pesquisador responsável:Sabri Saeed Mohamed Ahmed Al-Sanabani
Beneficiário:Sabri Saeed Mohamed Ahmed Al-Sanabani
Instituição-sede: Instituto de Medicina Tropical de São Paulo (IMT). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Pesq. associados:Ester Cerdeira Sabino
Assunto(s):Doenças transmissíveis  Infecções por Deltaretrovirus  Vírus linfotrópico T tipo 1 humano  Análise de sequência de DNA 

Resumo

O HTLV-1 foi o primeiro retrovírus humano a ser isolado, e demonstrando que causa um amplo espectro de manifestações clínicas, incluindo a ATLL (leucemia/linfoma de células T no adulto) Mielopatia Associada ao HTLV-1/Paraparesia Espástica Tropical (HAM/TSP). O período de latência no desenvolvimento da ATLL pode ser extremamente longo (30 a 50 anos), indicando que são necessários diversos eventos genéticos e virais para que ocorra a ATLL. Os mecanismos responsáveis pela transformação celular no curso para ATLL ainda não são totalmente compreendidos. Acredita-se que a continua expressão de proteínas virais do HTLV, especialmente tax, e a proliferação de linfócitos podem aumentar a probabilidade de inflamação e estimular a migração celular, desta forma, elevando assim, o risco de HAM/TSP e outras doenças inflamatórias associadas a esse vírus. Além disso, com a elevada produção e proliferações de linfócitos há maiores chances de aquisição de mutações, elevando o risco de transformação maligna e o desenvolvimento de ATLL. Nos últimos anos, estudos in vivo e in vitro revelam uma ausência de expressão de tax em aproximadamente 60% no estagio final de leucemias. Esses resultados intrigantes levantam uma questão importante, quais são os outros fatores necessários para manter o fenótipo de células leucêmicas na ausência de tax? Uma possível resposta para esta pergunta pode estar na "desregulação" dos miRNAs em células transformadas (ATLL), pois eles podem modificar contínua ou permanentemente a regulação dos padrões de expressão gênica celular e manutenção do fenótipo maligno independentemente da proteína tax. Alguns estudos têm demonstrado que células infectadas com HTLV possuem diferentes níveis de expressão de miRNAs e ainda sugerem que a tax seria a responsável pela transformação celular e os miRNAs pela persistência desta transformação. Além disso, esses estudos também apontam para o gene rex como um atenuador possível de resposta antiviral intracelular, agindo como um silenciador de miRNAs. Neste contexto, parece que a quantificação miRNAs fornece informações mais completas sobre as moléculas envolvidas na regulação celular.Neste estudo, pretendemos avaliar os níveis de expressão de todos os miRNAs em células T indivíduos infectados pelo HTLV-1 (assintomáticos (com células monoclonais e policlonais), com ATLL, com HAM/TSP). Nossa abordagem para medir os níveis de expressão, identificação de potenciais novos miRNAs e/ou isoformas, análise da expressão de tax e rex e determinação de clonalidade em células T, envolve a utilização de seqüenciamento em larga escala (nova geração) onde determinaremos a análise quantitativa dos miRNAs em cada grupo. Acreditamos que uma análise comparativa destas moléculas em cada grupo deverá render resultados importantes sobre a expressão e possível identificação de miRNAs e/ou isoformas envolvidas com a patogênese do HTLV-1 e doenças relacionadas. Pretendemos utilizar ainda a tecnologia de seqüenciamento de nova geração para ressaltar a importância de avalia (AU)

Publicações científicas (11)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
PEREIRA DA FONSECA, TAIRACAN AUGUSTO; PESSOA, RODRIGO; SANABANI, SABRI SAEED. Molecular investigation of bacterial communities: Data from two frequently used surfaces in the Sao Paulo Institute of Tropical Medicine. DATA IN BRIEF, v. 8, p. 399-403, SEP 2016. Citações Web of Science: 1.
PESSOA, RODRIGO; LOUREIRO, PAULA; LOPES, MARIA ESTHER; CARNEIRO-PROIETTI, ANNA B. F.; SABINO, ESTER C.; BUSCH, MICHAEL P.; SANABANI, SABRI S. Ultra-Deep Sequencing of HIV-1 near Full-Length and Partial Proviral Genomes Reveals High Genetic Diversity among Brazilian Blood Donors. PLoS One, v. 11, n. 3 MAR 31 2016. Citações Web of Science: 13.
PEREIRA DA FONSECA, TAIRACAN AUGUSTO; PESSOA, RODRIGO; FELIX, ALVINA CLARA; SANABANI, SABRI SAEED. Diversity of Bacterial Communities on Four Frequently Used Surfaces in a Large Brazilian Teaching Hospital. INTERNATIONAL JOURNAL OF ENVIRONMENTAL RESEARCH AND PUBLIC HEALTH, v. 13, n. 2 FEB 2016. Citações Web of Science: 6.
PEREIRA DA FONSECA, TAIRACAN AUGUSTO; PESSOA, RODRIGO; SANABANI, SABRI SAEED. Molecular Analysis of Bacterial Microbiota on Brazilian Currency Note Surfaces. INTERNATIONAL JOURNAL OF ENVIRONMENTAL RESEARCH AND PUBLIC HEALTH, v. 12, n. 10, p. 13276-13288, OCT 2015. Citações Web of Science: 6.
PESSOA, RODRIGO; SABINO, ESTER C.; SANABANI, SABRI S. Frequency of coreceptor tropism in PBMC samples from HIV-1 recently infected blood donors by massively parallel sequencing: the REDS II study. VIROLOGY JOURNAL, v. 12, MAY 14 2015. Citações Web of Science: 2.
PESSOA, RODRIGO; WATANABE, JAQUELINE TOMOKO; CALABRIA, PAULA; ALENCAR, CECILIA SALETE; LOUREIRO, PAULA; LOPES, MARIA ESTHER; PROETTI, ANNA BARBARA; FELIX, ALVINA CLARA; SABINO, ESTER C.; BUSCH, MICHAEL P.; SANABANI, SABRI S.; RECIPIENT, INT COMPONENT NHLBI. Enhanced detection of viral diversity using partial and near full-length genomes of human immunodeficiency virus Type 1 provirus deep sequencing data from recently infected donors at four blood centers in Brazil. Transfusion, v. 55, n. 5, p. 980-990, MAY 2015. Citações Web of Science: 7.
PESSOA, RODRIGO; WATANABE, JAQUELINE TOMOKO; CALABRIA, PAULA; FELIX, ALVINA CLARA; LOUREIRO, PAULA; SABINO, ESTER C.; BUSCH, MICHAEL P.; SANABANI, SABRI S.; RECIPIENT, INT COMPONENT NHLBI. Deep Sequencing of HIV-1 near Full-Length Proviral Genomes Identifies High Rates of BF1 Recombinants Including Two Novel Circulating Recombinant Forms (CRF) 70_BF1 and a Disseminating 71_BF1 among Blood Donors in Pernambuco, Brazil. PLoS One, v. 9, n. 11 NOV 17 2014. Citações Web of Science: 13.
PESSOA, RODRIGO; WATANABE, JAQUELINE TOMOKO; NUKUI, YOUKO; PEREIRA, JULIANA; KASSEB, JORGE; PENALVA DE OLIVEIRA, AUGUSTO CESAR; SEGURADO, ALUISIO COTRIM; SANABANI, SABRI SAEED. Molecular Characterization of Human T-Cell Lymphotropic Virus Type 1 Full and Partial Genomes by Illumina Massively Parallel Sequencing Technology. PLoS One, v. 9, n. 3 MAR 31 2014. Citações Web of Science: 25.
LEAL, FABIO E.; NDHLOVU, LISHOMWA C.; HASENKRUG, AARON M.; BRUNO, FERNANDA R.; CARVALHO, KARINA I.; WYNN-WILLIAMS, HARRY; NETO, WALTER K.; SANABANI, SABRI S.; SEGURADO, ALUISIO C.; NIXON, DOUGLAS F.; KALLAS, ESPER G. Expansion in CD39(+) CD4(+) Immunoregulatory T Cells and Rarity of Th17 Cells in HTLV-1 Infected Patients Is Associated with Neurological Complications. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 7, n. 2 FEB 2013. Citações Web of Science: 9.
SANABANI, SABRI SAEED; NUKUI, YOUKO; PEREIRA, JULIANA; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; SOARES DE OLIVEIRA, ANA CAROLINA; PESSOA, RODRIGO; LEAL, FABIO EUDES; SEGURADO, ALUISIO C.; KALLAS, ESPER GEORGES; SABINO, ESTER CERDEIRA. Lack of evidence to support the association of a single IL28B genotype SNP rs12979860 with the HTLV-1 clinical outcomes and proviral load. BMC INFECTIOUS DISEASES, v. 12, DEC 23 2012. Citações Web of Science: 9.

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