Nova vertente para descoberta de biomoléculas, lacases, com aplicação biotecnológica (LBMPMetaDB)

• Processo: 16/23892-2
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2017
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2019
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Ciência do Solo
• Pesquisador responsável: Eliana Gertrudes de Macedo Lemos
• Beneficiário: Eliana Gertrudes de Macedo Lemos
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Camila Cesario Fernandes ; Daniel Guariz Pinheiro ; Elisângela Soares Gomes Pepe ; Erica Mendes Lopes ; Luciano Takeshi Kishi
• Assunto(s): Clonagem Enzimas Metagenoma Biotecnologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: biotecnologia | clonagem | enzimas | metagenoma | Prospecção de genes | Bioquimica de Microrgarnismos

Resumo

Mineração de dados metagenômicos e genômicos tem crescido exponencialmente nos últimos anos, devido a grande quantidade de dados gerados pelo sequenciamento de nova geração entretanto há uma sobrecarga nas bases de dados utilizada para a análise. A estruturação de uma base de dados que permita entender analisar e possivelmente prospectar genes e organismos dentro do grupo de pesquisa daria mais velocidade para as pesquisas com a facilidade no acesso a grande informação contida nos genomas e metagenomas e assim auxiliar os grupos de pesquisa a explorar os resultados já obtidos em diversos estudos, com o objetivo de desvendar o inexplorado, tanto em nível de organismos como genes e metabolitos secundários. Assim, o objetivo desse projeto é implementar um sistema WEB para montagem e anotação de Metagenomas, através de pipelines testados pelo grupo, servindo como um sistema que possa ser utilizado para qualquer tipo de metagenoma de um banco local de genes a partir do resultado da mineração daqueles com interesse biotecnológico, e assim prospectar enzimas importantes e versáteis tais como as lacases para aplicação biotecnológica por exemplo em biorremediação e bioenergia entre outros, e ainda avaliar a diferença quanto as diferentes funções e estruturas. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

FERNANDES, GABRIELA CABRAL; SIERRA, ELWI GUILLERMO MACHADO; BREAR, PAUL; PEREIRA, MARIANA RANGEL; LEMOS, ELIANA G. M.. From Data Mining of Chitinophaga sp. Genome to Enzyme Discovery of a Hyperthermophilic Metallocarboxypeptidase. MICROORGANISMS, v. 9, n. 2, FEB 2021. (16/23892-2)