Um laboratório de neuroinformática com uma estratégia de conhecimento baseada na web e computação de alta performance

• Processo: 08/51445-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Jovens Pesquisadores
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2008
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2010
• Área de conhecimento: Engenharias - Engenharia Biomédica - Engenharia Médica
• Pesquisador responsável: Griselda Esther Jara de Garrido
• Beneficiário: Griselda Esther Jara de Garrido
• Instituição Sede: Instituto do Coração Professor Euryclides de Jesus Zerbini (INCOR). Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da USP (HCFMUSP). Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 03/11794-6 - Um laboratório de neuroinformática com uma estratégia de gerenciamento de conhecimento baseada na web e computação de alta performance, AP.JP
• Assunto(s): Neuroimagem Informática médica Gestão do conhecimento
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Beowulf | Case | Computacao Paralela | Modelos Neuronais | Neuroimagem | Neuroinformatica

Resumo

Esta proposta consiste na implementação de um laboratório de neuroinformática para pesquisa sobre funcionamento e anatomia cerebral, principalmente humana. O objetivo principal será o desenvolvimento e implementação de técnicas de análise cerebrais que respondam a questionamentos sobre uma doença (ex. Alzheimer) ou processo cognitivo específico (ex. memória de curto prazo) levantado por neurocientistas nos laboratórios parceiros (São Paulo, Rio de Janeiro, Japão). Para isto, um conjunto de ferramentas para processamento e análise de imagens cerebrais será instalado. Todas as etapas dos processos realizados (armazenamento de dados, documentos sobre a pesquisa, resultados, etc) serão implementados utilizando ferramentas "CASE". Dados de ressonância magnética funcional e estrutural disponíveis publicamente e provenientes dos laboratórios colaboradores serão analisados estatisticamente (nível macroscópico) e correlacionados com modelos neuronais (nível microscópico) disponíveis no banco de dados GÊNESIS, ou criados/modificados com o software homônimo. Estes modelos neuronais de alta escala e outras ferramentas de processamento paralelo poderão ser processados num "cluster Beowulf" Linux no último ano do projeto, quando todos os recursos estiverem consolidados. (AU)