Confinamento Molecular e Sítio Ativo de Proteínas

• Processo: 10/02001-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2010
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2014
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Física
• Pesquisador responsável: Elso Drigo Filho
• Beneficiário: Fabricio Ramos Silva
• Instituição Sede: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Método variacional Biofísica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Confinamento Molecular | Ligações Moleculares | Método Variacional | Molécula de Oxigênio | Sítio Ativo de Proteínas | Biofísica

Resumo

O estudo de sistemas quânticos confinados tem fornecido importantes contribuições à compreensão da natureza quântica da matéria e a aplicações tecnológicas. Uma abordagem teórica sobre o assunto tem sido possível através do uso do Método Variacional. Os trabalhos nessa área têm se concentrado principalmente na análise de partículas sujeitas a potenciais de força central em sistemas. Entretanto, já é possível encontrar trabalhos envolvendo a análise de moléculas. Por outro lado, em sistemas biológicos, o sítio ativo de proteínas, em geral, se localiza em uma região protegida das macromoléculas, isolando assim influências do meio. A idéia central desse projeto ésimular o sítio ativo de proteínas como uma cavidade e estudar o comportamento de uma molécula diatômica dentro dessa cavidade. Resultados preliminares indicam que para a molécula de hidrogênio ionizada os efeitos do confinamento levam a uma região de maior estabilidade molecular. Tal resultado é importante, uma vez que pode ser um indicativo que sítios ativos proporcionem uma maior estabilidade à molécula durante seu transporte. Logo, o próximo passo nessa linha de estudo, é a análise de uma molécula que participe efetivamente do mecanismo sítio ativo/resíduo em uma proteína. A molécula de oxigênio deverá ser analisada em regime de confinamento. A aproximação dos orbitais moleculares como uma combinação linear dos orbitais atômicos deve ser usada aliada ao Método Variacional para que seja possível obter resultados quantitativos sobre o sistema. Também pretende-se discutir as implicações biológicas dos resultados.

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

SILVA, Fabricio Ramos. Confinamento das moléculas H2 e O2 como modelo para o estudo da ligação ligante-sítio ativo em macromoléculas biológicas. 2014. Tese de Doutorado - Universidade Estadual Paulista (Unesp). Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas. São José do Rio Preto São José do Rio Preto.