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Caracterização da microbiota associada ao muco de corais escleractíneos do litoral do Estado de São Paulo por pirosequenciamento

Processo: 10/02325-6
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de maio de 2010
Data de Término da vigência: 30 de abril de 2014
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Laura Maria Mariscal Ottoboni
Beneficiário:Camila Carlos
Instituição Sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Assunto(s):Microbiota   Pirosequenciamento
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:corais escleractíneos | Microbiota | pirosequenciamento | 16S | Genética Molecular e de Microorganismos

Resumo

Os recifes de corais são ecossistemas sensíveis que estão ameaçados pelas mudanças climáticas. Apesar de sua importância econômica e ecológica, muitos recifes de corais têm diminuído nas últimas décadas devido a presença de estresses no seu habitat. Entre os estresses está a poluição, a super exploração, o turismo desgovernado, entre outros. Estima-se que nos últimos 30 anos, houve uma redução de 30% dos corais em todo o mundo, devida principalmente a doenças emergentes. A principal delas é o branqueamento, que consiste na perda da alga endossimbionte, que confere a cor ao coral, e realiza fotossíntese disponibilizando carbono fixado ao coral. Aparentemente, o branqueamento está relacionado com estresse térmico e com patógenos do gênero Vibrio. Estudos têm demonstrado a importância da microbiota associada aos corais na resistência a doenças e estresses. Apesar de não existirem recifes de corais no litoral do Estado de São Paulo, duas espécies de corais escleractíneos (ou corais-pétreos), formadores de recifes, são encontradas na forma de colônias isoladas. Estas duas espécies, Mussismilia hispida e Madracis decactis, são importantes na manutenção do equilíbrio da fauna bentônica no estado. Não existe nenhum estudo de comunidade microbiana destas espécies no Estado de São Paulo. Sendo assim, o objetivo deste projeto é caracterizar a microbiota associada ao muco de corais escleractíneos do litoral do Estado de São Paulo por pirosequenciamento. Amostras serão no litoral norte se sul do Estado de São Paulo. Serão coletadas, nos períodos de verão e inverno, amostras do muco de Mussismilia hispida e Madracis decactis e, amostras da água do entorno que serão utilizadas como controle. Amostras do muco do coral mole Palythoa caribaeorum também serão analisadas a fim de se identificar os microrganismos específicos dos corais escleractíneos. Serão identificadas as bactérias e arqueias associadas aos corais por pirosequenciamento do rDNA 16S e, eucariotos pelo pirosequenciamento do rDNA 18S. Também será identificada a atividade antimicrobiana dos microrganismos do muco de todas as amostras. Este estudo ajudará a entender a dinâmica destas comunidades microbianas durante duas estações do ano, os padrões biogeográficos da composição desta comunidade e, as relações hospedeiro-específicas nos corais escleractíneos do Estado de São Paulo. Além disso, a caracterização da atividade antimicrobiana ajudará a esclarecer o papel da microbiota do muco na saúde e proteção dos corais.

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Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
CARLOS, CAMILA; PEREIRA, LETICIA BIANCA; MARISCAL OTTOBONI, LAURA MARIA. Comparative genomics of Paracoccus sp.SM22M-07 isolated from coral mucus: insights into bacteria-host interactions. CURRENT GENETICS, v. 63, n. 3, p. 509-518, . (10/50247-4, 10/02325-6)
PEREIRA, LETICIA B.; PALERMO, BRUNA R. Z.; CARLOS, CAMILA; OTTOBONI, LAURA M. M.. Diversity and antimicrobial activity of bacteria isolated from different Brazilian coral species. FEMS Microbiology Letters, v. 364, n. 16, . (10/50247-4, 10/02325-6)
CARLOS, CAMILA; ASSUMPCAO CASTRO, DANIEL BEDO; OTTOBONI, LAURA M. M.. Comparative Metagenomic Analysis of Coral Microbial Communities Using a Reference-Independent Approach. PLoS One, v. 9, n. 11, . (10/50247-4, 10/02325-6)
CARLOS, CAMILA; TORRES, TATIANA T.; OTTOBONI, LAURA M. M.. Bacterial communities and species-specific associations with the mucus of Brazilian coral species. SCIENTIFIC REPORTS, v. 3, . (10/50247-4, 10/02325-6)
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
CARLOS, Camila. Caracterização taxonômica e funcional da comunidade bacteriana associada a corais do Estado de São Paulo. 2014. Tese de Doutorado - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Biologia Campinas, SP.