Exploração de uma biblioteca genômica de Passiflora edulis f. flavicarpa por sequenciamento de BAC-ends

• Processo: 11/03840-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2011
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2013
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Maria Lúcia Carneiro Vieira
• Beneficiário: Anselmo Azevedo dos Santos
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Genomas Biblioteca genômica Biologia computacional Passiflora Cooperação técnica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: BAC-end | Biblioteca de BAC | bioinformática | Genômica | Passiflora | Genética Vegetal

Resumo

O maracujá-amarelo (Passiflora edulis f. flavicarpa) é uma frutífera de importância econômica no Brasil, sendo apreciado para a produção suco concentrado e para o consumo in natura, além de ser usado pela indústria farmacêutica na extração da passiflorina. Nosso grupo de pesquisa tem trabalhado no sentido de gerar um corpo de conhecimentos teóricos sobre as espécies comerciais de Passiflora, investigando populações segregantes para construir mapas de ligação e mapear locos quantitativos com base na sua caracterização fenotípica e molecular. Entretanto, pouco se sabe sobre a composição e a organização genômica do maracujá-amarelo. Recentemente, em colaboração com o INRA de Toulouse, França, providenciamos aconstrução de uma biblioteca genômica de P. edulis f. flavicarpa inserida emBACs (Ped-B-Flav). Esta biblioteca contém 82944 clones, dando uma cobertura de aproximadamente 6 X o genoma da espécie. Como via para ampliar o conhecimento existente sobre a espécie, neste trabalho, pretende-se usar a estratégia de sequenciamento de BAC-ends, objetivando lançar luz sobre esse genoma ainda obscuro: assim, será possível identificar um grande número regiões codificadoras de proteínas, candidatos a marcadores moleculares e elementos transponíveis, além de se ter ideia da sua organização. Espera-se com este estudo dar um grande salto em relação ao que se conhece sobre o genoma das passifloras, e, também, disponibilizar, à comunidade científica, novas ferramentas que facilitem o desenvolvimento de novos estudos teóricos e aplicados ao melhoramento da cultura. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

SANTOS, Anselmo Azevedo dos. Exploração de uma biblioteca genômica de Passiflora edulis f. flavicarpa por sequenciamento de BAC-ends. 2013. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALA/BC) Piracicaba.