Exploitation of a genomic library of Passiflora edulis f. flavicarpa using BAC-end sequencing

• Grant number: 11/03840-4
• Support Opportunities: Scholarships in Brazil - Master
• Start date: August 01, 2011
• End date: February 28, 2013
• Field of knowledge: Biological Sciences - Genetics - Plant Genetics
• Principal Investigator: Maria Lúcia Carneiro Vieira
• Grantee: Anselmo Azevedo dos Santos
• Host Institution: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brazil

Abstract

O maracujá-amarelo (Passiflora edulis f. flavicarpa) é uma frutífera de importância econômica no Brasil, sendo apreciado para a produção suco concentrado e para o consumo in natura, além de ser usado pela indústria farmacêutica na extração da passiflorina. Nosso grupo de pesquisa tem trabalhado no sentido de gerar um corpo de conhecimentos teóricos sobre as espécies comerciais de Passiflora, investigando populações segregantes para construir mapas de ligação e mapear locos quantitativos com base na sua caracterização fenotípica e molecular. Entretanto, pouco se sabe sobre a composição e a organização genômica do maracujá-amarelo. Recentemente, em colaboração com o INRA de Toulouse, França, providenciamos aconstrução de uma biblioteca genômica de P. edulis f. flavicarpa inserida emBACs (Ped-B-Flav). Esta biblioteca contém 82944 clones, dando uma cobertura de aproximadamente 6 X o genoma da espécie. Como via para ampliar o conhecimento existente sobre a espécie, neste trabalho, pretende-se usar a estratégia de sequenciamento de BAC-ends, objetivando lançar luz sobre esse genoma ainda obscuro: assim, será possível identificar um grande número regiões codificadoras de proteínas, candidatos a marcadores moleculares e elementos transponíveis, além de se ter ideia da sua organização. Espera-se com este estudo dar um grande salto em relação ao que se conhece sobre o genoma das passifloras, e, também, disponibilizar, à comunidade científica, novas ferramentas que facilitem o desenvolvimento de novos estudos teóricos e aplicados ao melhoramento da cultura. (AU)

Academic Publications

(References retrieved automatically from State of São Paulo Research Institutions)

SANTOS, Anselmo Azevedo dos. Exploitation of a genomic library of Passiflora edulis f. flavicarpa using BAC-end sequencing. 2013. Master's Dissertation - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALA/BC) Piracicaba.