Análise funcional do papel da enzima DNA metiltransferase 2 (DNMT2) no desenvolvimento e resposta à estresses e identificação e caracterização de fragmentos derivados de tRNA (tRFs) em Arabidopsis thaliana.

• Processo: 11/19512-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2012
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2015
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Fabio Tebaldi Silveira Nogueira
• Beneficiário: Cristiane de Santis Alves
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 07/58289-5 - Isolamento e caracterização de microRNAs e seus genes alvo em cana-de-açúcar, AP.BIOEN.JP
• Bolsa(s) vinculada(s): 13/21108-4 - Possível papel epigenético duplo da DNA methiltransferase 2 (DNMT2) em Arabidopsis thaliana, BE.EP.DR
• Assunto(s): Arabidopsis Desenvolvimento
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Arabidopsis | desenvolvimento | Dnmt2 | metilação de RNA e DNA | tRNA-derived fragments | Genética Molecular de Plantas

Resumo

A metilação do DNA está relacionada à regulação gênica, memória celular, silenciamento de elementos transponíveis, imprinting genômico e repressão de pseudo-elementos provenientes de sequências duplicadas. Os padrões de metilação são estabelecidos, mantidos e traduzidos em estados funcionais apropriados da maquinaria de metilação do DNA, a qual inclui uma família classificada em três grupos de enzimas do tipo metiltransferases: DNMT1, DNMT3 e DNMT2. A DNA metiltransferase 2 (DNMT2) foi identificada na busca de novos candidatos à uma segunda DNA metiltransferase. Esta enzima não possui função biológica definida, porém, é capaz de metilar tanto DNA quanto RNA, em especial RNA transportadores (tRNAs). A DNMT2 está localizada tanto no núcleo quanto no citoplasma em células humanas, sendo capaz de migrar do núcleo para o citoplasma em resposta à estresses celulares. É no citoplasma que a enzima irá metilar o tRNA, possivelmente para protegê-lo contra clivagens em situações de estresse. Quando estas clivagens ocorrem de forma específica, pequenos fragmentos de RNA são gerados (denominados tRFs), fato observado em diversas espécies, incluindo Arabidopsis thaliana. Aparentemente, estes fragmentos de RNA fazem parte de uma nova via de interferência por RNA. Contudo, seu papel biológico ainda não foi revelado. O objetivo deste trabalho é determinar a função da enzima DNMT2 de plantas durante o desenvolvimento e em resposta a estresses, além de estabelecer seu possível papel na biogênese dos tRFs.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

ALVES, CRISTIANE S.; VICENTINI, RENATO; DUARTE, GUSTAVO T.; PINOTI, VITOR F.; VINCENTZ, MICHEL; NOGUEIRA, FABIO T. S.. Genome-wide identification and characterization of tRNA-derived RNA fragments in land plants. Plant Molecular Biology, v. 93, n. 1-2, p. 35-48, JAN 2017. (11/19512-6, 07/58289-5)