Estudo e desenvolvimento de uma GUI baseada em C++/QT/VTK para programas de modelagem de proteínas

• Processo: 12/23001-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2013
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2014
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Metodologia e Técnicas da Computação
• Pesquisador responsável: Rinaldo Wander Montalvão
• Beneficiário: Emanuel Iglesias
• Instituição Sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 11/11343-0 - Usando dados esparsos de ressonância magnética nuclear e modelagem comparativa para determinar estrutura e dinâmica de proteínas com aplicação em desenho racional de drogas, AP.JP
• Assunto(s): Biologia computacional Metodologia e técnicas de computação Simulação de dinâmica molecular Proteínas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Dinâmica Molecular | Gui | modelagem por homologia | Proteinas | Bioinformática

Resumo

O objetivo principal desse projeto é desenvolver uma Interface Gráfica de Usuário (GUI) para programas de modelagem de proteínas e, em particular, para o nosso sistema de modelagem chamado SALUS. O programa SALUS é um sistema híbrido de usado para a determinação simultânea da estrutura terciária e da dinâmica de proteínas de interesse para o desenho racional de drogas. Ele será usado para solucionar a estrutura de proteínas, onde métodos tradicionais de Cristalografia por Raios-X e Ressonância Magnética Nuclear (RMN) falham em produzir um modelo confiável. A ideia é gerar um conjunto de estruturas proteicas que refletem os dados experimentais, através do uso de dois procedimentos distintos: Modelagem Comparativa de Proteínas e Dinâmica Molecular Auxiliada por RMN.A GUI irá empregar um código moderno em C++ em combinação com a biblioteca multi-plataforma QT e a biblioteca de visualização científica VTK para criar um sistema completo para automatizar todos os passos do processo de determinação de uma estrutura proteica da forma usada por SALUS. Isso não apenas permitirá aos usuários configurar de forma fácil um processo de modelagem, usando qualquer combinação de dados experimentais usados por SALUS, mas também permitirá ao usuário visualizar, validar e analisar os resultados.(AU)