Algoritmos de estimação de distribuição para predição ab initio de estruturas de proteínas

• Processo: 13/00919-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 30 de março de 2013
• Data de Término da vigência: 29 de julho de 2013
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Sistemas de Computação
• Pesquisador responsável: Alexandre Cláudio Botazzo Delbem
• Beneficiário: Daniel Rodrigo Ferraz Bonetti
• Supervisor: Jochen Einbeck
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação (ICMC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Durham University (DU), Inglaterra
• Vinculado à bolsa: 10/02928-2 - Algoritmos de estimação de distribuição para predição ab initio de estruturas de proteínas, BP.DR
• Assunto(s): Algoritmos Probabilidade Elementos estruturais de proteínas Métodos ab initio
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Ab initio | Algoritmo de Estimação de Distribuição | Predição de estruturas de proteínas | Probabilidade Conjunta | Algoritmos Evolutivos

Resumo

O bolsista está em fase de desenvolvimento do Algoritmo de Estimação de Distribuição para Predição de Estruturas de Proteínas (PSP). Para geração de variáveis relacionadas é necessário utilizar técnicas estatísticas que consigam captar a dependência entre variáveis contínuas. Atualmente, isso está sendo realizado utilizando o método do Kernel. No entanto, tal método é computacionalmente custoso. Por esse motivo espera-se estudar novas maneiras de estimar a probabilidade conjunta de variáveis contínuas. Assim, por meio de contato previamente estabelecido com o prof. Jochen Einbeck da Universidade de Durham Inglaterra, espera-se, por meio de um estágio no exterior, estudar uma técnica alternativa para a estimação da probabilidade conjunta, podendo obter predições de qualidade com menos custo computacional. (AU)