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Meta-aprendizado e Redes Bayesianas na Criação de Comitês de Classificação de Dados de Expressão Gênica

Processo: 12/22295-0
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de março de 2013
Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2015
Área de conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Metodologia e Técnicas da Computação
Pesquisador responsável:André Carlos Ponce de Leon Ferreira de Carvalho
Beneficiário:Edwin Rafael Villanueva Talavera
Instituição Sede: Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação (ICMC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):14/10852-7 - Detecção de interações funcionais gene-gene a partir de dados observacionais de expressão gênica utilizando comitês de classificadores e Meta-aprendizagem, BE.EP.PD
Assunto(s):Aprendizado computacional   Redes bayesianas   Meta-aprendizado computacional   Classificação
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:análise de expressão gênica | Aprendizado de Máquina | Classificação | Comites de classificadores | Meta-Aprendizado | Redes Bayesianas | Aprendizado de máquina

Resumo

Aprendizado de maquina tem sido utilizado com sucesso em Bioinformatica. O emprego da informação de expressão gênica de tecidos biológicos para classificá-los em categorias ou classes conhecidas tem gerado grandes expectativas no aperfeiçoamento do diagnóstico, prognóstico e possível tratamento de doenças severas, como o câncer. Não obstante, a construção de classificadores acurados para esse propósito tem mostrado ser uma tarefa desafiadora, dada a elevada dimensionalidade dos dados de expressão e à natureza ruidosa dos mesmos. Entre as abordagens mais promissoras para lidar com dito problema encontram-se os chamados comitês de classificadores, em que as decisões de vários classificadores são combinadas, na esperança de gerar uma classificação mais robusta. No entanto, a criação de um comitê é um problema complexo, e as técnicas existentes para essa finalidade induzem frequentemente sistemas de classificação sub-ótimos e pouco interpretáveis. Neste projeto pretende-se estudar de que maneira o potencial das metodologias de meta-aprendizado e redes Bayesianas poderia ser usado para facilitar a tarefa de criação de comitês de classificadores de expressão gênica, metodologias que têm sido bem sucedidas em diversos domínios, mas muito pouco exploradas no problema em estudo.

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
ESPEZUA, SOLEDAD; VILLANUEVA, EDWIN; MACIEL, CARLOS D.; CARVALHO, ANDRE. A Projection Pursuit framework for supervised dimension reduction of high dimensional small sample datasets. Neurocomputing, v. 149, n. B, p. 767-776, . (12/22295-0)
ESPEZUA, SOLEDAD; VILLANUEVA, EDWIN; MACIEL, CARLOS D.; CARVALHO, ANDRE. A Projection Pursuit framework for supervised dimension reduction of high dimensional small sample datasets. Neurocomputing, v. 149, p. 10-pg., . (12/22295-0)