Administração do banco de dados SiGLEM para catalogação de espécimes de formigas Attini e suporte para desenvolvimento de sistema de anotação de genomas.

• Processo: 13/02098-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2013
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2014
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Mauricio Bacci Junior
• Beneficiário: Milene Ferro
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Rio Claro. Rio Claro , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 11/50226-0 - Taxonomia, sistemática e filogeografia em sistemas Attini, AP.BTA.R
• Assunto(s): Biologia computacional Coleção e conservação de espécies biológicas Banco de dados
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Banco de dados | bioinformática | coleções biológicas | Bioinformática

Resumo

Material de cerca de 1000 espécimes de formigas Attini será organizado e catalogado no banco de dados SiGLEM, existente em nosso laboratório. Este material constitui-se em amostras em via seca, amostras em via úmida, material gênico, imagens e dados bibliográficos. As imagens taxonomicamente informativas serão produzidas pelo Bolsista e incluídas na base de dados. Todas as imagens e informações sobre as espécies de formigas estarão disponíveis para consulta através de páginas web com acesso público e interface amigável ao usuário. A organização desses dados irá permitir o rápido acesso às amostras coletadas e a exposição dos dados de nossa coleção entomológica na rede mundial de computadores. Um sistema de anotação de genomas e metagenomas está atualmente em desenvolvimento em nosso laboratório. Tal sistema demanda constante atividade de instalação de ferramentas de Bioinformática e desenvolvimento de programas computacionais. O Bolsista TT5 solicitado será também responsável pelo suporte ao desenvolvimento desse sistema de anotação, incluindo desenvolvimento de scripts, instalação de ferramentas e bancos de dados, bem como administração e manutenção de um servidor para armazenamento e processamento de dados moleculares.