Desenvolvimento de um transcriptoma de referência para cana-de-açúcar: aspectos evolutivos e a sua aplicação na compreensão do metabolismo de sacarose

• Processo: 13/05171-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2013
• Data de Término da vigência: 17 de junho de 2014
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Renato Vicentini dos Santos
• Beneficiário: Guilherme Targino Valente
• Instituição Sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 08/58031-0 - Equilíbrio energético da cana-de-açúcar: uma abordagem de sistemas para compreender a regulação do metabolismo da sacarose e a sinalização de açúcar, AP.BIOEN.JP
• Assunto(s): Biologia computacional Análise de sequência de RNA Biologia de sistemas Expressão gênica Transcriptoma Cana-de-açúcar
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: biologia de sistemas | cana-de-açúcar | expressão gênica | metabolismo de sacarose | RNA-seq | Transcriptoma | Bioinformática

Resumo

A cana-de-açúcar (Saccharum spp.) é responsável por 2/3 da produção mundial de açúcar e tem o maior balanço de energia entre as plantas cultivadas. Apesar de pesquisas terem sido desenvolvidas visando o estudo do metabolismo de sacarose e sua regulação, o conhecimento dos mecanismos moleculares acerca desse processo em cana-de-açúcar são ainda incipientes. As características genômicas dos cultivares modernos de cana, como por exemplo a alta ploidia, tem inviabilizado a utilização de métodos de genômica para o desenvolvimento de cultivares melhorados, apesar disso, dados referentes aos genes expressos vem sendo produzidos nos últimos anos. Frente a demanda crescente por biocombustível e aos aspectos biológicos da produção da sacarose, a presente proposta de pesquisa visa a construção de um transcriptoma de referência para o gênero Saccharum, onde análises de expressão gênica em diferentes transcriptomas bem como seus aspectos evolutivos e estudos de redes de interação entre proteínas serão aplicadas. O principal aspecto biológico a ser investigado, baseado nas frentes de investigação citadas, será o metabolismo de sacarose e sua regulação em cana-de-açúcar. Todos as sequencias necessárias para a execução dessa proposta já estão disponíveis e dessa forma, o presente projeto focará em análises de bioinformática para atingir os objetivos propostos. Planeja-se vincular a presente proposta a um projeto já subsidiado pela FAPESP, o qual gerou muitas das sequencias de RNA-Seq exigidas. Os resultados esperados contribuirão para a geração de uma referência para os pesquisadores na área de biocombustível, genética quantitativa e genômica funcional e poderá contribuir para uma maior compreensão da produção de sacarose em Saccharum e em outras gramíneas.