Assinaturas de seleção em dados genotípicos de alta densidade do Projeto HapMap Bovino

• Processo: 13/17203-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2014
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2016
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: José Fernando Garcia
• Beneficiário: Pier Kenji Rauschkolb Katsuda Ito
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina Veterinária (FMVA). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Araçatuba. Araçatuba , SP, Brasil
• Assunto(s): Genômica Melhoramento genético animal Variação genética Polimorfismo de um único nucleotídeo Genótipo Bovinos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: assinatura de seleção | bovino | Genótipo | Melhoramento genético | Snp | Genômica

Resumo

O Brasil ocupa a primeira colocação do ranking de países exportadores de carne bovina, e as projeções para o setor mostram um crescimento anual de 2,0% para os próximos dez anos. Assim, é manifesta a necessidade de pesquisas que levem ao desenvolvimento de tecnologias que possam prover acréscimos eficazes na produtividade dos rebanhos. Iniciativas como o sequenciamento do genoma bovino e o projeto HapMap, originaram gama de ferramentas capazes de acelerar o melhoramento genético dos rebanhos. Uma destas ferramentas baseia-se em marcadores genéticos do tipo polimorfismo de base única (SNP do termo em inglês Single-nucleotide Polymorphism), capaz de fornecer uma cobertura ampla de todo o genoma ao interrogar simultaneamente 777.962 SNP. Esta tecnologia popularizou os estudos de "assinaturas de seleção". Em humanos, os estudos de assinatura de seleção permitiram elucidar a maneira como as alterações culturais e ambientais atuam moldando o genoma e identificar genes que contribuem para ou são causadores de doenças. Neste tipo de estudo, procura-se detectar as "pegadas" deixadas no genoma pelos mecanismos de seleção, que atuam alterando as frequências alélicas deixando uma marca na estrutura de variação genotípica. Nos bovinos, devido à forte seleção artificial, geralmente a localização destas assinaturas estará associada uma região controladora de características de produção. Sendo assim, o presente projeto visa adaptar e validar metodologia para procurar regiões indicativas de assinaturas de seleção nos genomas de diferentes raças bovinas.