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Desenvolvimento de um algoritmo para a montagem do genoma poliploide de cana-de-açúcar

Processo: 14/10948-4
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Vigência (Início): 01 de julho de 2014
Vigência (Término): 31 de janeiro de 2016
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Convênio/Acordo: Microsoft Research
Pesquisador responsável:Glaucia Mendes Souza
Beneficiário:Luiz Fernando Goda Zuleta
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Empresa:Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Química (IQ)
Vinculado ao auxílio:12/51062-3 - Desenvolvimento de um algoritmo para a montagem do genoma poliplóide de cana-de-açúcar, AP.BIOEN.PITE
Assunto(s):Análise de sequência de DNA   Clonagem

Resumo

Os 700 clones de BACs da variedade SP80-3280 devem ser submetidos a um preparo de alta qualidade de extração de DNA e rendimento. Do mesmo modo, uma planilha contendo a lista de todos os BACs selecionados pelo projeto BioEn deverá estar disponível para o grupo caso haja interesse de uso pelos grupos. A estratégia para garantir a disponibilidade e acesso deve contar com um técnico que ficará dedicado no início do projeto (2 anos) para esta organização. A maioria das metodologias estão em andamento e padronizadas no laboratório porém encontram-se dispersas entre os alunos de doutorado ou pesquisadores em estágio PD. A consolidação em um único pesquisador especialista em Biologia Molecular permitirá ganho de eficiência e agilidade em vários dos processos experimentais. (AU)