Métodos genético-estatísticos para seleção genômica em Panicum maximum com informação de dosagem alélica

• Processo: 15/20659-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2016
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2017
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia
• Pesquisador responsável: Antonio Augusto Franco Garcia
• Beneficiário: Letícia Aparecida de Castro Lara
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 16/01279-7 - Métodos genético-estatísticos para seleção genômica em Panicum maximum com informação de dosagem alélica, BE.EP.DR
• Assunto(s): Genética estatística Melhoramento genético vegetal Panicum maximum Forragem Técnicas genéticas Poliploidia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: forragem | Genética Estatística | melhoramento de plantas | Poliplóides | Melhoramento Genético Vegetal

Resumo

O objetivo principal desse projeto é desenvolver modelos genético-estatísticos em seleção genômica para Panicum maximum. A população de treinamento consiste na população base de ciclo zero de seleção recorrente intrapopulacional do programa de melhoramento de Panicum maximum da Embrapa Gado de Corte. As populações de seleção serão os ciclos seguintes do programa. A população base deste programa foi formada pelo intercruzamento de 20 plantas sexuais, selecionadas a partir de populações biparentais. As avaliações fenotípicas foram realizadas em oito cortes, ao nível de plantas individuais. Os caracteres avaliados foram: produção de matéria seca total, foliar e de colmo; porcentagem de lâmina foliar; relação lâmina foliar/colmo; capacidade de rebrota e caracteres de valor nutricional. Os dados moleculares serão obtidos utilizando-se marcadores GBS e doses de alelos quantificadas a partir do software SuperMASSA. Os dados genotípicos e fenotípicos serão aplicados em modelos de seleção genômica, sendo incluídos efeitos de interação Genótipo x Corte. Serão analisados modelos com abordagem frequentista (regressões penalizadas) e bayesiana. O modelo que melhor representar a variação dos dados e melhor predizer os valores genéticos de um determinado caráter, será utilizado para aplicação da seleção de genótipos superiores. Desta forma, espera-se reduzir o tempo por ciclo de seleção e aumentar o ganho por unidade de tempo do programa de seleção recorrente, bem como melhorar as plantas sexuais da Embrapa, para que estas possam ser utilizadas para produção de híbridos superiores. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

LARA, LETICIA A. DE C.; SANTOS, MATEUS F.; JANK, LIANA; CHIARI, LUCIMARA; VILELA, MARIANE DE M.; AMADEU, RODRIGO R.; DOS SANTOS, JHONATHAN P. R.; PEREIRA, GUILHERME DA S.; ZENG, ZHAO-BANG; GARCIA, ANTONIO AUGUSTO F.. Genomic Selection with Allele Dosage in Panicum maximum Jacq.. G3-GENES, GENOMES, GENETICS, v. 9, n. 8, p. 2463-2475, AUG 2019. (16/01279-7, 15/20659-2, 17/03625-2, 17/25674-5)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

LARA, Letícia Aparecida de Castro. Modelos genéticos-estatísticos para seleção genômica em Panicum maximum com informação de dosagem alélica. 2017. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALA/BC) Piracicaba.