Métodos genético-estatísticos para seleção genômica em Panicum maximum com informação de dosagem alélica

• Processo: 16/01279-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 22 de março de 2016
• Data de Término da vigência: 21 de setembro de 2016
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia
• Pesquisador responsável: Antonio Augusto Franco Garcia
• Beneficiário: Letícia Aparecida de Castro Lara
• Supervisor: Zhao-Bang Zeng
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: North Carolina State University (NC State), Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 15/20659-2 - Métodos genético-estatísticos para seleção genômica em Panicum maximum com informação de dosagem alélica, BP.DR
• Assunto(s): Genética estatística Melhoramento genético vegetal Forragem Panicum maximum Técnicas genéticas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: forragem | Genética Estatística | melhoramento de plantas | Poliplóides | Melhoramento Genético Vegetal

Resumo

O objetivo principal desse projeto é desenvolver modelos genético-estatísticos para seleção genômica em Panicum maximum (forrageira autotetraploide). A população de treinamento consiste na população base de ciclo zero de seleção recorrente intrapopulacional do programa de melhoramento da Embrapa Gado de Corte. As populações de seleção serão os ciclos seguintes do programa. A população base deste programa foi formada pelo intercruzamento de 20 plantas sexuais, selecionadas a partir de populações biparentais. As avaliações fenotípicas foram obtidas em 600 indivíduos, em oito cortes, em delineamento de blocos aumentados. Os caracteres avaliados foram: produção de matéria seca total, foliar e de colmo; porcentagem de lâmina foliar; relação lâmina foliar/colmo; capacidade de rebrota e caracteres de valor nutricional. Os dados moleculares foram obtidos utilizando-se marcadores GBS e as doses de alelos serão quantificadas usando o software SuperMASSA. A informação de dosagem alélica será contemplada nos modelos preditivos com a finalidade de investigar a importância dessa inclusão para a acurácia de seleção quando aplicado em espécies poliploides. Os dados genotípicos e fenotípicos serão aplicados em modelos de seleção genômica, sendo incluídos efeitos de interação Genótipo x Corte. Serão analisados modelos com abordagem frequentista (regressões penalizadas) e bayesiana. O modelo que melhor representar a variação dos dados e melhor predizer os valores genéticos de um determinado caráter, será utilizado para aplicação da seleção de genótipos superiores. Desta forma, espera-se reduzir o tempo por ciclo de seleção e aumentar o ganho por unidade de tempo do programa de seleção recorrente, bem como melhorar as plantas sexuais da Embrapa. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

LARA, LETICIA A. DE C.; SANTOS, MATEUS F.; JANK, LIANA; CHIARI, LUCIMARA; VILELA, MARIANE DE M.; AMADEU, RODRIGO R.; DOS SANTOS, JHONATHAN P. R.; PEREIRA, GUILHERME DA S.; ZENG, ZHAO-BANG; GARCIA, ANTONIO AUGUSTO F.. Genomic Selection with Allele Dosage in Panicum maximum Jacq.. G3-GENES, GENOMES, GENETICS, v. 9, n. 8, p. 2463-2475, AUG 2019. (16/01279-7, 15/20659-2, 17/03625-2, 17/25674-5)