Desenvolvimento de base de conhecimento de dados ômicos de regulação transcricional em microalgas

• Processo: 17/25859-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2018
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2020
• Área de conhecimento: Interdisciplinar
• Acordo de Cooperação: NSF - Dimensions of Biodiversity e BIOTA
• Pesquisador responsável: Flavia Vischi Winck
• Beneficiário: Rodrigo Raúl Dorado Goitia
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 16/06601-4 - Análise integrativa de sistemas para o estudo de redes de regulação da expressão gênica relacionadas à produção de biomassa em microalgas, AP.BIOEN.JP
• Assunto(s): Biologia computacional Biologia de sistemas Microalgas Biomassa Expressão gênica Fatores de transcrição Banco de dados
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bancos de Dados | bioinformática | Engenharia | Omicas | Plataformas web | Sistemas | Biologia de Sistemas

Resumo

A atual conjuntura sócio-ambiental demanda novas alternativas para o desenvolvimento de fontes de energia renovável e geração de produtos de valor agregado com base no uso de biomassa renovável e tecnologias limpas. Neste contesto, as microalgas fotossintetizantes aparecem como promissores organismos capazes de atuar na biorremediação ambiental de forma acoplada a seu uso em bioprocessos de geração de compostos de valor agregado, tais como biocombustíveis e pigmentos de alto valor de mercado. Entretanto, o estudo e aplicação das microalgas em processos de escalas industriais ainda é incipiente, carecendo de avanços significativos no conhecimento da biologia das microalgas para o fomento de seu uso em aplicações biotecnológicas. Com o estudo de respostas celulares com base no uso de plataformas ômicas, tais como a proteômica, transcriptômica e metabolômica é possível desvendarmos componentes de redes biológicas envolvidas com a capacidade celular de acúmulo de biomassa ou de outros compostos de alto valor agregado (Aucoin, et al., 2016). Nesta proposta, dados gerados utilizando-se as plataformas "ômicas" para células cultivadas em diferentes condições de cultivo, principalmente aquelas associadas ao incremento de biomassa, serão disponibilizados através de uma base de dados pública que contenha o detalhamento das informações obtidas e também dados de expressão gênica de fatores de transcrição e fatores de regulação, o que permitirá que pesquisadores interessados em estratégias de bioengenharia de microalgas possam selecionar genes alvos candidatos. Esta base de dados, terá acesso via web e recursos estarão disponíveis "on-line" para usuários cadastrados. (AU)