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Bolsa TTIII em procedimentos moleculares: estudos sistemáticos integrados em famílias neotropicais, com ênfase em Rutaceae, Asteraceae e Rubiaceae

Processo: 18/07262-4
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Vigência (Início): 01 de maio de 2018
Vigência (Término): 31 de dezembro de 2018
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Botânica - Taxonomia Vegetal
Pesquisador responsável:Milton Groppo Júnior
Beneficiário:Laura Fernandes Afonso
Instituição-sede: Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:16/06260-2 - Estudos sistemáticos integrados em famílias neotropicais, com ênfase em Rutaceae, Asteraceae e Rubiaceae, AP.R
Assunto(s):Filogenia   Biologia molecular vegetal   Rutaceae   Asteraceae   Rubiaceae   Técnicas e procedimentos de laboratório   Reagentes de laboratório

Resumo

Esta solicitação de bolsista de capacitação técnica está ligada aos procedimentos de biologia molecular do projeto. O bolsista realizará atividades que consistem em empregar metodologias de rotina para obtenção de sequências que serão utilizadas em análises filogenéticas de plantas, com o objetivo de elucidar as relações filogenéticas nos grupos envolvidos. A aprovação desta solicitação será importante para o andamento das pesquisas do projeto citado, visto que não há técnico destinado pela USP ao laboratório de Sistemática de Plantas. As atividades do bolsista envolverão familiarização com técnicas de extração de DNA de plantas utilizando material foliar seguindo protocolos já consagrados em literatura, amplificação de segmentos do DNA do cloroplasto e de DNA nuclear. Depois de amplificadas, as sequências serão obtidas preferencialmente no Centro de Recursos Biológicos e Biologia Genômica (CREBIO-Unesp-Jaboticabal). A edição das sequências obtidas e a familiarização com alguns métodos de análise em filogenia molecular também estão previstas. O bolsista também poderá se envolver em resumos dos trabalhos em eventos científicos e a elaboração de artigos científicos para publicação em periódicos de circulação nacional e internacional, dependendo da contribuição intelectual apresentada. Além do treinamento em procedimentos que envolvam biologia molecular, haverá também a necessidade do bolsista se envolver na manutenção do laboratório especializado em procedimentos moleculares. Este laboratório está alocado em uma sala que é parte do "Laboratório de Sistemática de Plantas". A sala é equipada com bancadas, capela, termocicladores, banho-maria, um foto-documentador de gel e geladeiras e freezers (para guarda de amostras). Grande parte deste equipamento foi adquirida com verba Fapesp de auxílios anteriores, principalmente processos 2006/03170-0 e 2011/10446-0. A manutenção envolve deste a supervisão do laboratório quanto ao controle de estoque de reagentes, auxílio em pedidos de compra e outras atividades inerentes a um laboratório desta natureza. Plano de Trabalho As atividades rotineiras do bolsista consistirão no emprego das metodologias citadas abaixo: 1) extração de DNA de fragmentos de folhas, seguindo protocolo modificado de Doyle & Doyle (1987) ou os procedimentos dos fabricantes, no caso de kits específicos para extração de DNA de plantas; 2) amplificação, purificação e sequenciamento dos fragmentos segundo metodologia de Taberlet et al. (1991), Andersson & Rova (1999), Scott et al. (2000), Groppo et al. (2008) ou outra metodologia pertinente; 3) edição de sequências com o uso do programa Biological Sequence Aligmment Editor (BioEdit) (copyright Tom Hall 1997-2001) ou similar mais atualizado; 4) utilização das sequências obtidas nos estudos de filogenia do gêneros em Rutaceae, Asteraceae e Rubiaceae em estudos filogenéticos; 5) elaboração de relatório de pesquisa e de participação em resumos e publicações do laboratório, em co-autoria, conforme o caso e a participação intelectual;6) Acompanhamento de alunos de iniciação científica e pós-graduação em atividades do laboratório. (AU)

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