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Relações filogenéticas e identificação de marcadores para apomixia e espécie-específicos do grupo Plicatula em genomas poliplóides de Paspalum

Processo: 18/18527-9
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de maio de 2019
Vigência (Término): 31 de agosto de 2023
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
Pesquisador responsável:Anete Pereira de Souza
Beneficiário:Fernanda Ancelmo de Oliveira
Instituição Sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):21/12838-5 - Análise integrativa para identificação de novos genes/regiões associados à apomixia e avaliação do potencial partenogenético do gene ASGR-BABY BOOML em arroz transgênico, BE.EP.PD
Assunto(s):Filogenia   Gramíneas forrageiras   Apomixia
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:apomixia | Filogenia | Gramíneas forrageiras | marcadores diagnósticos | Poliplóides | RAD-seq | Genética e Genômica de Plantas

Resumo

Paspalum é um importante gênero de gramínea forrageira nativa, de espécies predominantemente poliplóides e apomíticas de grande variabilidade genética e complexidade genômica. Representa um valioso recurso a ser explorado tanto no setor agropecuário como modelo biológico para pesquisa científica. Sobretudo, espécies de Plicatula, grupo botânico taxonomicamente intricado, de espécies promissoras para uso como forrageiras. Recentemente, o grupo UNICAMP-EMBRAPA realizou grandes avanços no conhecimento genético-genômico para algumas espécies não-modelo do gênero, disponibilizando ferramentas e um robusto conjunto de dados de escala genômica (marcadores SSR, transcriptoma e sequenciamento "RAD-seq"). A partir dos dados de RAD-seq, este projeto prevê estudar a variação alélica de SNPs pela estimativa de dosagem alélica para espécies poliploides do grupo Plicatula, visando inferir a relação filogenética e delimitação de suas espécies, além do desenvolvimento de um painel de marcadores moleculares espécie-específicos e associados a apomixia, característica altamente desejável na agricultura. Os resultados gerados e marcadores diagnósticos desenvolvidos beneficiarão o uso desse valioso germoplasma e os programas de melhoramento genético de Paspalum, resultando na diminuição do tempo necessário para o lançamento de novas cultivares e na geração de genótipos com maior valor agregado.

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Publicações científicas (6)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
LOPES DA SILVA, RAYLEEN WHAITI; MACHADO, SARAH SILVA; FARIA, KARINA DE CASSIA; DE OLIVEIRA, BETANIA ARCANJO; DE SOUZA, ELISAMA BATISTA; DE OLIVEIRA, FERNANDA ANCELMO; PINTO DE MENEZES, IVANDILSON PESSOA; DA SILVA, JOAQUIM MANOEL. Diversity and Genetic Structure of Dipteryx alata Vogel (Fabaceae) Populations in the Cerrado-Amazon Ecotone, Brazil. PLANT MOLECULAR BIOLOGY REPORTER, v. N/A, p. 11-pg., . (18/18527-9)
DE OLIVEIRA, FERNANDA A.; VIGNA, BIANCA B. Z.; DA SILVA, CARLA C.; FAVERO, ALESSANDRA P.; DE MATTA, FREDERICO P.; AZEVEDO, ANA L. S.; DE SOUZA, ANETE P.. Coexpression and Transcriptome analyses identify active Apomixis-related genes in Paspalum notatum leaves. BMC Genomics, v. 21, n. 1, . (08/52197-4, 18/18527-9, 15/24346-9)
QUEIROZ, MARIA CRISTINA VITELLI; DE OLIVEIRA, FERNANDA ANCELMO; DE SOUZA, ANETE PEREIRA; SATO, MARIO EIDI. Development of microsatellite markers for the predatory mite Phytoseiulus macropilis and cross-amplification in three other species of phytoseiid mites. Experimental and Applied Acarology, v. 83, n. 1, . (16/06919-4, 18/18527-9, 17/50334-3, 15/26288-6)
MACHADO, RAQUEL MOURA; DE OLIVEIRA, FERNANDA ANCELMO; DE MATOS ALVES, FABIO; DE SOUZA, ANETE PEREIRA; FORNI-MARTINS, ELIANA REGINA. Population Genetics of Polyploid ComplexPsidium cattleyanumSabine (Myrtaceae): Preliminary Analyses Based on New Species-Specific Microsatellite Loci and Extension to Other Species of the Genus. BIOCHEMICAL GENETICS, v. 59, n. 1, p. 219-234, . (18/18527-9)
DE OLIVEIRA, GEOVANI LUCIANO; NIEDERAUER, GUILHERME FRANCIO; DE OLIVEIRA, FERNANDA ANCELMO; RODRIGUES, CINTHIA SOUZA; HERNANDES, JOSE LUIZ; DE SOUZA, ANETE PEREIRA; MOURA, MARA FERNANDES. Genetic diversity, population structure and parentage analysis of Brazilian grapevine hybrids after half a century of genetic breeding. Scientia Horticulturae, v. 311, p. 9-pg., . (18/13539-9, 20/12938-7, 18/18527-9)
RAYLEEN WHAITI LOPES DA SILVA; SARAH SILVA MACHADO; KARINA DE CASSIA FARIA; FERNANDA ANCELMO DE OLIVEIRA; ANETE PEREIRA DE SOUZA; IVANDILSON PESSOA PINTO DE MENEZES; JOAQUIM MANOEL DA SILVA. Molecular insight for baru Dipteryx alata (Fabaceae) populations based on novel SSRs. Acta Botanica Brasilica, v. 37, . (18/18527-9)

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