Análise da variação alélica em genes de importância econômica entre regiões hom(e)ólogas do genoma de cana-de-açúcar (Saccharum spp.)

Resumo

A cultura da cana-de-açúcar possui grande importância econômica devido à produção de açúcar e etanol, sendo o Brasil o maior produtor mundial de cana. Os cultivares modernos de cana-de-açúcar são híbridos interespecíficos (Saccharum officinarum x S. spontaneum), sendo seu genoma poliploide e aneuploide, fato que dificulta a construção de mapas genéticos e identificação de QTLs (Quantitative Trait Loci). O conhecimento da variação na sequência de bases de diferentes alelos possibilita a obtenção de informações da variação inter e intra-genótipos de uma espécie. Uma técnica eficiente para se acessar a variação alélica entre locos hom(e)ólogos em uma espécie é através do sequenciamento de locos gênicos específicos e de interesse, identificados em clones BAC (Bacterial Artificial Chromosomes). Desta maneira, o presente projeto visa a descoberta e análise de polimorfismos alélicos existentes em regiões cromossômicas hom(e)ólogas de cana-de-açúcar e comparar a organização alélica entre estas regiões através da utilização de genes que codificam uma proteína DnaJ e uma Trealose-6-fosfato sintase/fosfatase. SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) encontrados serão utilizados para avaliar a expressão gênica de haplótipos específicos e poderão ser integrados a mapas genéticos em desenvolvimento. A análise destas regiões aliada a técnica de FISH (Fluorescent in Situ Hybridization) possibilitará a localização física dos genes estudados. No caso específico de cana-de-açúcar, a identificação da expressão alelo específica pode ajudar a explicar os mecanismos de expressão de cada dose de cada alelo. (AU)