Avaliação da variabilidade alélica, estrutura populacional e desequilíbrio de ligação no germoplasma ex situ de seringueira (Hevea brasiliensis)

Resumo

O desmatamento da Amazônia ameaça os recursos genéticos de muitas espécies nativas dessa região. Entre as espécies ameaçadas está o gênero Hevea, exclusivamente oriundo da floresta Amazônica, Hevea brasiliensis é uma espécie emblemática da região Amazônica, devido ao seu papel histórico no desenvolvimento econômico dos estados que compõem a Amazônia. A seringueira é a base da indústria que utiliza borracha natural. Entretanto, devido a um efeito forte efeito de restrição na base genética, mais de 95% das áreas cultivadas com seringueiras no mundo são plantadas com clones provenientes de apenas 5 a 10 árvores. A diversidade genética da espécie ainda está presente em populações nativas na área de distribuição natural, mas é ameaçada pelo ritmo acelerado de desmatamento. O objetivo central do presente projeto é a caracterização da diversidade genética de clones de seringueira coletados em diferentes regiões da Amazônia, por meio de marcadores moleculares do tipo "polimorfismo de uma única base" (single nucleotide polymorphism - SNP). Esses marcadores serão desenvolvidos a partir da comparação de sequências de um banco de ESTs (Expressed Sequence Tags) de seringueira e, a partir de resultados do transcriptoma de seringueira (pelo sequenciamento de nova geração). Os SNPs desenvolvidos serão genotipados empregando-se um espectrômetro de massas MALDI-TOF (Sequenom). Os dados de variabilidade obtidos serão empregados na construção de um mapa, no estudo da estrutura populacional e do desequilíbrio de ligação das populações representando o germoplasma da Amazônia, atualmente presente nos bancos de germoplasma e, portanto disponível ao melhoramento genético. Todos os resultados de variabilidade genética, do desequilíbrio de ligação e da estrutura populacional gerados, bem como os recursos genômicos (SNPs) desenvolvidos no presente projeto serão úteis aos estudos de genética e aos programas de melhoramento da H. brasiliensis, visando o aumento da produção de borracha. Os resultados também serão úteis aos esforços para a conservação das espécies de Hevea na Amazônia, pois auxiliarão a tomada de medidas com o objetivo de preservar a diversidade genética da seringueira e espécies aparentadas. (AU)