Epidemiologia molecular de Xanthomonas citri, o agente causal do cancro cítrico em São Paulo

• Processo: 19/18059-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2019
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2020
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitossanidade
• Acordo de Cooperação: CONFAP ; Newton Fund, com FAPESP como instituição parceira no Brasil ; UK Academies
• Pesquisador responsável: Henrique Ferreira
• Beneficiário: Hayen Alonso
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Rio Claro. Rio Claro , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 19/05497-7 - Epidemiologia molecular de patógenos mutiresistentes a drogas no Brasil e desenvolvimento de novas estratégias de controle, AV.EXT
• Assunto(s): Fitopatologia Genomas Análise de sequência de DNA Genética populacional Diversidade genética Cancro (doença de planta) Xanthomonas citri São Paulo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Isolamento Bacteriano | Sequenciamento de genomas | fitopatologia

Resumo

ACC é causada pela bactéria Xanthomonas citri subsp. citri (X. citri), que causa queda de frutos, desfolha e até morte da planta. Sabe-se pouco sobre sua diversidade em São Paulo, pois poucos estudos foram realizados levando-se em conta a descrição detalhada da estrutura genética da população bacteriana espalhada no estado e pela falta de foco epidemiológico nas análises. O sequenciamento de genomas é o padrão ouro para se examinar a estrutura genética/populacional e pode fornecer subsídios para estudos das causas das doenças, traçar caminhos de espalhamento dos patógenos e fornecer dados sobre a evolução de resistência antimicrobiana. Entretanto, tais metodologias foram aplicadas a subgrupos de isolados de X. citri em São Paulo. Neste, examinaremos a diversidade e epidemiologia de X. citri isoladas de plantas em São Paulo e usando sequenciamento de genomas. Compararemos dados com relatos de isolados históricos e outros de outros países. Este estudo mostrará a estrutura genética da população atual em áreas de alta, média e baixa incidência de ACC. Fornecerá informações sobre o espalhamento da ACC, se existem linhagens hiper-virulentas, a frequência de troca de material genético entre isolados e com espécies diferentes de bactérias e a magnitude do problema de resistência a cobre.