As Fundações de Amparo à Pesquisa (FAPs) estaduais, dentre elas a FAPESP, e reunidas no Conselho Nacional das Fundações Estaduais de Amparo à Pesquisa (CONFAP), compartilham de um Memorando de Entendimento para Cooperação em ações de Ciência, Tecnologia e Inovação. Visando ao lançamento de diversas oportunidades de financiamento para os pesquisadores do Estado de São Paulo, a FAPESP estabeleceu acordos de cooperação com algumas organizações e, em alguns casos, incluindo o CONFAP pelo lado brasileiro. O acordo com o Newton Fund, iniciativa britânica que visa promover o desenvolvimento social e econômico dos países parceiros, por meio de pesquisa, ciência e tecnologia, com o objetivo de implementar a cooperação científica e tecnológica entre pesquisadores britânicos e do Estado de São Paulo, mediante o financiamento de projetos conjuntos de pesquisa.