Estudo in silico para identificar associação entre miRNAs e genes diferencialmente expressos na Síndrome de Down

• Processo: 19/21548-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2019
• Data de Término da vigência: 31 de outubro de 2020
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Erika Cristina Pavarino
• Beneficiário: Isabela Possari
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto (FAMERP). Secretaria de Desenvolvimento Econômico (São Paulo - Estado). São José do Rio Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia computacional Síndrome de Down Expressão gênica Marcadores inflamatórios MicroRNAs Genes Sistema imune Processos biológicos Análise in silico
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: expressão gênica | marcadores ínflamatórios | MicroRNAs | Sindrome de Down | Biologia Molecular

Resumo

O catálogo mais recente de anotação de genes e de microRNAs (miRNAs), moléculas de RNAs não-codificantes envolvidas na regulação gênica pós-transcricional, do cromossomo 21, inclui mais de 223 genes codificantes e 30 miRNAs (HGNC, 2019). A contribuição desses miRNAs para o fenótipo da síndrome de Down (SD) é pouco investigada, mas há evidências de que a alteração na sua expressão possa estar relacionada à manifestações da síndrome. O fenótipo da SD é complexo e variável entre os indivíduos; inclui alterações imunológicas que resultam em frequência aumentada de infecções e doenças autoimunes. Estudos mostram que alguns genes envolvidos no sistema imune apresentam expressão alterada em indivíduos com SD, entretanto, pouco se conhece sobre as interações existentes entre inflamação, resposta imune e a expressão de miRNAs. Considerando-se o cenário metabólico da SD; a expressão diferencial de microRNAs, localizados em outros cromossomos, e não no cromossomo 21, também poderia resultar na expressão alterada de inúmeros genes, incluindo aqueles envolvidos na resposta imune. Assim, a presente proposta tem como objetivos: realizar uma análise de bioinformática (in silico) para identificar associação entre miRNAs e genes, relacionados ao sistema imunológico, diferencialmente expressos em nossos estudos anteriores realizados em crianças com SD, utilizando-se o software online MicroT-CDS; identificar os processos biológicos mais representados entre os genes diferencialmente expressos e os microRNAs que regulam estes genes, utilizando-se o programa The Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery (DAVID) v 6.7 e analisar a interação entre as proteínas pela ferramenta STRING - v 11.0.