Do espécime à sequência: preparação de amostras para sequenciamento utilizando plataforma Illumina

• Processo: 19/23665-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2020
• Data de Término da vigência: 29 de fevereiro de 2020
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Zoologia - Taxonomia dos Grupos Recentes
• Pesquisador responsável: Marcelo Visentini Kitahara
• Beneficiário: Ágatha Nascimento Carpinelli
• Instituição Sede: Instituto do Mar (IMar). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus Baixada Santista. Santos , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 14/01332-0 - Filogenômica da ordem Scleractinia (Cnidaria, Anthozoa): relações entre evolução da ordem e mudanças climáticas, AP.PFPMCG.JP
• Assunto(s): Filogenia molecular Scleractinia Métodos analíticos de preparação de amostras Sequenciamento de nova geração Extração de DNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Captura de regiões ultraconservador | Preparação de bibliotecas | Scleractinia | Sequenciamento de última geração | Sistemática molecular

Resumo

A presente proposta visa treinar um técnico nível TT III em diferentes técnicas empregadas na preparação de amostras, sequenciamento e aquisição de dados em plataformas de sequenciamento Illumina utilizando preparação de bibliotecas TrueSeq para estudos moleculares voltados a filogenômica. As atividades serão divididas em duas etapas: 1) aquisição de dados - focada na extração de DNA genômico de amostras de corais da Ordem Scleractinia, e preparação de bibliotecas para sequenciamento; e 2) técnicas de controle de qualidade e limpeza de sequências. O treinamento tem duração prevista de 24 meses. (AU)