Desenvolvimento de banco de dados de variantes genéticas DesBraVar (Depósito de Sequencias Brasileiras e Variantes)

• Processo: 19/21290-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2020
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2021
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Sistemas de Computação
• Pesquisador responsável: Maria Rita dos Santos e Passos Bueno
• Beneficiário: Diego Lima de Carvalho
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 13/08028-1 - CEGH-CEL - Centro de Estudos do Genoma Humano e de Células-Tronco, AP.CEPID
• Assunto(s): Genômica Variação genética Desenvolvimento de software Banco de dados Processamento de dados
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Banco de dados | Database | Desenvolvimento de Software | Genômica | Banco de Dados

Resumo

Desenvolver uma aplicação que servirá tanto como repositório para armazenamento de dados genômicos, quanto para software com web interface para análise de variantes genéticas (via client-side) e processamento de dados de sequenciamento de exoma e genoma de várias centenas de indivíduos (via server-side). Configuração dos servidores de processamento, armazenamento e web server; respectiva manutenção nos mesmos. Integração da aplicação DesBraVar (banco de dados genômico) com o sistema de prontuário eletrônico (banco de dados fenotípico) do CEGH-CEL. Reestruturação do banco de dados do sistema de prontuário eletrônico e eventuais manutenções na aplicação. Eventuais atividades de manutenção, suporte técnico e desenvolvimento de sites e ferramentas vinculadas ao CEGH-CEL.