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Modelos bayesianos para estimação da taxa de ataque de epidemias

Processo: 19/21858-0
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2021
Data de Término da vigência: 31 de julho de 2024
Área de conhecimento:Engenharias - Engenharia Elétrica - Telecomunicações
Pesquisador responsável:Vitor Heloiz Nascimento
Beneficiário:Carlos Augusto Prete Junior
Instituição Sede: Escola Politécnica (EP). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):22/15985-1 - Aprimoramento de estimativas de número de reprodução efetivo com dados genômicos, BE.EP.DR
Assunto(s):Epidemiologia   COVID-19   Estudos soroepidemiológicos   Sistemas não lineares   Processamento de sinais   Redes bayesianas   Análise estatística   Pandemias
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Epidemiologia | identificabilidade | Modelos Bayesianos | Sistemas Não-lineares | Sororeversão | Sorovigilância | Processamento de Sinais

Resumo

A inferência do percentual da população infectada por um agente infeccioso (taxa de ataque) em tempo real é fundamental para o monitoramento de epidemias emergentes e predição das trajetórias futuras de epidemias. A estimativa da taxa de ataque é dificultada na prática pelo alto custo de testagem em massa, por atrasos no registro de testes em pacientes hospitalizados, e no caso de doenças como COVID-19, pelo alto índice de pacientes assintomáticos ou com sintomas leves, que não chegam a procurar os serviços de saúde. Uma forma de baixo custo para estimar a taxa de ataque em tempo real é fazer medidas de soroprevalência na população, através de testes em amostras de doadores de sangue. No entanto, esses testes são afetados por vieses causados pelo fenômeno da sororeversão, que ocorre em diversos ensaios e consiste em uma queda da reatividade do teste ao longo do tempo, levando a um decaimento da sensibilidade e dificultando a obtenção de estimativas confiáveis de soroprevalência. Neste projeto, propõe-se desenvolver modelos Bayesianos que permitam a estimativa da soroprevalência corrigida pela sororeversão. Também propõe-se estudar a identificabilidade prática destes modelos, permitindo o cálculo do número de amostras para que a estimativa de soroprevalência seja aceitável. Finalmente, propõe-se estudar a sensibilidade das estimativas às distribuições a priori dos parâmetros assumidas pelo modelo. Como modelos Bayesianos são utilizados em diversas áreas, e como problemas de identificabilidade aparecem em inúmeras aplicações científicas, espera-se que os algoritmos desenvolvidos tenham ampla aplicação. (AU)

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Publicações científicas (12)
(As publicações científicas contidas nesta página são originárias da Web of Science ou da SciELO, cujos autores mencionaram números dos processos FAPESP concedidos a Pesquisadores Responsáveis e Beneficiários, sejam ou não autores das publicações. Sua coleta é automática e realizada diretamente naquelas bases bibliométricas)
FARIA, NUNO R.; MELLAN, THOMAS A.; WHITTAKER, CHARLES; CLARO, INGRA M.; CANDIDO, DARLAN DA S.; MISHRA, SWAPNIL; CRISPIM, MYUKI A. E.; SALES, FLAVIA C.; HAWRYLUK, IWONA; MCCRONE, JOHN T.; et al. . Science, v. 372, n. 6544, p. 815+, . (20/04558-0, 19/21568-1, 19/21301-5, 18/14389-0, 17/13981-0, 20/04272-9, 18/25468-9, 16/18445-7, 19/21858-0, 18/17176-8, 19/12000-1, 19/07544-2, 18/12579-7, 19/24251-9)
PRETE JR, CARLOS A.; NASCIMENTO, VITOR H.; LOPES, CASSIO G.. . Entropy, v. 23, n. 12, . (19/21858-0, 18/12579-7)
PRETE, JR., CARLOS A.; BUSS, LEWIS F.; BUCCHERI, RENATA; ABRAHIM, CLAUDIA M. M.; SALOMON, TASSILA; CRISPIM, MYUKI A. E.; OIKAWA, MARCIO K.; GREBE, EDUARD; DA COSTA, ALLYSON G.; FRAIJI, NELSON A.; et al. . BMC INFECTIOUS DISEASES, v. 22, n. 1, . (19/21858-0, 18/14389-0)
LI, SABRINA L.; PEREIRA, RAFAEL H. M.; PRETE JR, CARLOS A.; ZAREBSKI, ALEXANDER E.; EMANUEL, LUCAS; ALVES, PEDRO J. H.; PEIXOTO, PEDRO S.; BRAGA, CARLOS K., V; DE SOUZA SANTOS, ANDREZA ARUSKA; DE SOUZA, WILLIAM M.; et al. . BMJ GLOBAL HEALTH, v. 6, n. 4, p. 11-pg., . (19/21858-0, 19/24251-9, 18/14389-0, 17/13981-0)
BRIZZI, ANDREA; WHITTAKER, CHARLES; SERVO, LUCIANA M. S.; HAWRYLUK, IWONA; PRETE JR, CARLOS A.; DE SOUZA, WILLIAM M.; AGUIAR, RENATO S.; ARAUJO, LEONARDO J. T.; BASTOS, LEONARDO S.; BLENKINSOP, ALEXANDRA; et al. . Nature Medicine, v. 28, n. 7, p. 31-pg., . (19/21858-0)
VERNAL, SEBASTIAN; NAHAS, ANDRESSA K.; NETO, FRANCISCO CHIARAVALLOTI; PRETE JUNIOR, CARLOS A.; CORTEZ, ANDRE L.; SABINO, ESTER CERDEIRA; LUNA, EXPEDITO JOSE DE ALBUQUERQUE. . Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, v. 63, . (18/14389-0, 19/21858-0)
FELIPE DE MELLO MARTINS; ALESSANDRA PINHEIRO VIDAL; JEEVAN GIDDALURU; BERNARDO MAIA DA SILVA; EVA K. LEE; PEIJUE ZHANG; LUCAS ESTEVES CARDOZO; CARLOS AUGUSTO PRETE JUNIOR; HELVES HUMBERTO DOMINGUES; ESTER CERDEIRA SABINO; et al. . Einstein (São Paulo), v. 22, . (19/21858-0)
PRETE, CARLOS A., JR.; BUSS, LEWIS F.; WHITTAKER, CHARLES; SALOMON, TASSILA; OIKAWA, MARCIO K.; PEREIRA, RAFAEL H. M.; MOURA, ISABEL C. G.; DELERINO, LUCAS; BARRAL-NETTO, MANOEL; TAVARES, NATALIA M.; et al. . eLIFE, v. 11, p. 53-pg., . (18/14389-0, 19/21858-0)
CANDIDO, DARLAN DA SILVA; DELLICOUR, SIMON; COOPER, LAURA V.; PRETE, CARLOS A.; JORGENSEN, DAVID; UZZELL, CHRISTOPHER B.; VOORMAN, AREND; LYONS, HIL; KLAPSA, DIMITRA; MAJUMDAR, MANASI; et al. . NATURE MICROBIOLOGY, v. 10, n. 12, p. 17-pg., . (19/21858-0, 24/10682-6, 22/15985-1)
DE ALBUQUERQUE, FELIPE PROENCA; NASCIMENTO, RAFAEL; PRETE JR, CARLOS A.; DA COSTA, EDUARDO COELHO MARQUES. . ENERGIES, v. 17, n. 14, p. 21-pg., . (21/01325-7, 24/00261-3, 19/21858-0)
LI, SABRINA L.; PRETE JR, CARLOS A.; ZAREBSKI, ALEXANDER E.; SANTOS, ANDREZA ARUSKA DE SOUZA; SABINO, ESTER C.; NASCIMENTO, VITOR H.; WU, CHIEH-HSI; MESSINA, JANE P.. . BMJ OPEN, v. 14, n. 1, p. 10-pg., . (19/21858-0, 18/14389-0, 22/15985-1)
BUSS, LEWIS; PRETE, CARLOS A.; WHITTAKER, CHARLES; SALOMON, TASSILA; OIKAWA, MARCIO K.; PEREIRA, RAFAEL H. M.; MOURA, ISABEL C. G.; DELERINO, LUCAS; FRANCA, RAFAEL F. O.; MIYAJIMA, FABIO; et al. . VACCINES, v. 10, n. 9, p. 11-pg., . (18/14389-0, 19/21858-0)
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
PRETE JUNIOR, Carlos Augusto. Identificação de sistemas dinâmicos não lineares estocásticos para modelagem de epidemias.. 2024. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Politécnica (EP/BC) São Paulo.