Desvendando o papel dos sistemas de secreção de proteínas na promoção de crescimento vegetal por Pantoea agglomerans 33.1

• Processo: 21/04834-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2022
• Data de Término da vigência: 01 de junho de 2023
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Maria Carolina Quecine Verdi
• Beneficiário: Aline Aparecida Oliveira Ferreira
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 22/07666-3 - O papel ecológico dos sistemas de secreção de proteínas de Pantoea agglomerans 33.1 na modulação da comunidade bacteriana do solo, BE.EP.MS
• Assunto(s): Genética molecular vegetal Crescimento vegetal Genômica CRISPR-Cas9 Interações hospedeiro-patógeno
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: CRISPR-Cas9 | Genômica | nocaute gênico | Promoção de crescimento vegetal | Sistema de Secreção de proteínas | Genética Molecular e de Microorganismos

Resumo

Bactérias utilizam as mais diversas estratégias para garantir sua própria sobrevivência e também para colonizar seus hospedeiros. Muitas bactérias Gram-negativas, mutualistas ou patogênicas utilizam os Sistemas de Secreção de Proteínas (SSPs) para transportar proteínas e interagir com o ambiente, com outra bactéria ou até mesmo com outros organismos eucariontes. A espécie Pantoea agglomerans é uma bactéria Gram-negativa cosmopolita que apresenta uma vasta diversidade metabólica. Esta diversidade reflete nos diversos ambientes e hospedeiros em que a mesma pode ser encontrada: plantas, solos, animais e água. Em geral, P. agglomerans tem sido descrita como benéfica a diversas plantas, agindo na promoção do crescimento vegetal e no controle de fitopatógenos. Entretanto, alguns patovares são agentes causais de doenças em algumas culturas, evidenciando assim a complexidade na classificação e entendimento da biologia desta espécie a nível molecular. Como exemplo, a linhagem P. agglomerans 33.1, isolada endofíticamente de Eucalyptus grandis, apresenta comprovada promoção de crescimento vegetal em diversas culturas. Apesar da relevância agronômica de P. agglomerans como promotora de crescimento vegetal, são incipientes os estudos moleculares referentes a seus mecanismos de interação com a planta e, como diversas pesquisas abordam os SSPs em bactérias patogênicas, há pouco entendimento sobre o papel desses sistemas em bactérias benéficas. Assim, o objetivo deste projeto será sequenciar, montar e anotar o genoma da linhagem P. agglomerans 33.1; explorar seu genoma e comparar seus SSPs com os identificados em outras linhagens; e, finalmente, mediante o uso da técnica CRISPR-Cas9, avaliar o efeito do nocaute de genes-alvo dos SSPs na interação da bactéria com a planta e com outros microrganismos da comunidade. Os resultados obtidos neste estudo contribuirão com o entendimento da biologia dessa linhagem como promotora de crescimento, bem como da relevância dos SSPs de P. agglomerans em suas interações com o meio. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

FERREIRA, Aline Aparecida Oliveira. Desvendando o papel dos mecanismos moleculares envolvidos na promoção de crescimento vegetal e modulação da comunidade bacteriana do solo por Pantoea agglomerans 33.1. 2023. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALA/BC) Piracicaba.