Análise dos ligantes e da rede de interação da proteína fosfatase mitocondrial PGAM5

• Processo: 22/02313-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2022
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2023
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas
• Pesquisador responsável: Luciana Elena de Souza Fraga Machado
• Beneficiário: Sofia de Oliveira Farias
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 19/02605-3 - Modulação estrutural e funcional das proteínas fosfatases mitocondriais pelo metabolismo redox e as implicações na biologia celular, AP.JP
• Assunto(s): Biologia computacional Bioquímica de proteínas Proteínas tirosina fosfatases Mitocôndrias Fosfoglicerato mutase Técnicas in vitro
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: baseada em histidina | fosfoglicerato mutase | mitocôndria | Pgam5 | Proteína serina | treonina fosfatase | Bioquímica de protéinas

Resumo

A desfosforilação de proteínas pelas proteínas fosfatases é uma modificação pós-traducional essencial para a manutenção e processos regulatórios celulares. Essas enzimas podem desfosforilar resíduos de tirosina ou de serina/treonina, dependentes de resíduos nucleofílicos, como a cisteína, aspartato ou histidina. As proteínas fosfatases podem estar localizadas em diversos compartimentos celulares, como a mitocôndria. Contudo, muito pouco ainda se sabe sobre as proteínas fosfatases mitocondriais. Dentro das proteínas fosfatases mitocondriais, destaca-se a proteína serina treonina fosfatase dependente de histidina, denominada proteína fosfoglicerato mutase 5 (PGAM5) que vem sendo descrita em processos de apoptose celular. Sendo assim, pretendemos analisar os possíveis ligantes e as vias de sinalização celular que a proteína fosfatase mitocondrial PGAM5 está envolvida. Dessa forma, serão realizadas análises bioinformáticas para a identificação de ligantes da PGAM5 e as vias de sinalização envolvida. Em seguida serão realizados experimentos in vitro da interação entre a PGAM5 e dois ligantes através de experimentos de pull-down. Após a análise da interação entre as proteínas, caracterizaremos o motivo de interação com o objetivo de identificar novos possíveis ligantes. (AU)