| Processo: | 22/11129-3 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Mestrado |
| Data de Início da vigência: | 28 de outubro de 2022 |
| Data de Término da vigência: | 27 de fevereiro de 2023 |
| Área de conhecimento: | Ciências Agrárias - Recursos Pesqueiros e Engenharia de Pesca - Aquicultura |
| Pesquisador responsável: | Diogo Teruo Hashimoto |
| Beneficiário: | Shisley Cristina da Silva Manso |
| Supervisor: | José Manuel Yáñez |
| Instituição Sede: | Centro de Aquicultura (CAUNESP). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil |
| Instituição Anfitriã: | Universidad de Chile, Chile |
| Vinculado à bolsa: | 21/14869-5 - Predições genômicas para resistência a Aeromonas hydrophila em pacu Piaractus mesopotamicus, BP.MS |
| Assunto(s): | Melhoramento genético Arquitetura genética Resistência à doença Técnicas de genotipagem Polimorfismo de um único nucleotídeo |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Aeromoniose | Aquicultura sustentável | Arquitetura genética de resistência à doenças | Melhoramento genético | Painéis de genotipagem | polimorfismos de nucleotídeo único | Melhoramento genético |
Resumo Pacu Piaractus mesopotamicus é um dos mais importantes peixes nativos cultivados na América do Sul. Aeromonas hydrophila é uma bactéria gram-negativa de vida livre responsável por grandes perdas econômicas em sua produção. Estudos sobre a base genética da resistência do pacu cultivado à infecção por A. hydrophila revelaram uma arquitetura poligênica de resistência. No caso de características poligênicas, a seleção genômica pode melhorar significativamente a precisão da seleção dos valores genéticos em comparação com a seleção tradicional e, portanto, aumentar a resposta da seleção para resistência à infecção por A. hydrophila em pacu. O objetivo deste estudo é avaliar a capacidade de predição genômica usando uma estratégia de baixo custo que combina um painel de SNPs de baixa densidade e imputação genômica. DNA genômico de cinqüenta famílias de pacu de um núcleo de reprodução do Centro de Aquicultura da Unesp (CAUNESP/UNESP - Brasil) foi utilizado para este fim. Um painel de SNP de média densidade (Axiom SerraSNP) com aproximadamente ~20K SNPs, e um painel de SNP de baixa densidade (AgriSeq tGBS) com 1091 SNPs foram previamente construídos como um recurso para seleção genômica de pacu. O painel de SNP de baixa densidade será otimizado pela técnica de imputação de genótipos. A imputação de genótipos será avaliada combinando genótipos parentais obtidos através do painel de média densidade com genótipos de progênie do painel de SNPs de baixa densidade (1K SNPs). A alta precisão de imputação e predição genômica sugere que a imputação de genótipos de painéis de SNP de baixa densidade a média densidade de pacu pode ser uma estratégia economicamente viável para o desenvolvimento da seleção genômica para pacu, com grande utilidade para aplicação na seleção de genótipos resistentes a A. hydrophila, aumentando assim sua produção. (AU) | |
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