Análises evolutivas, metabólicas e de imunoinformática das proteínas de superfície de importância na relação patógeno-hospedeiro em organismos do filo Euglenozoa

• Processo: 22/01262-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2022
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Parasitologia - Protozoologia de Parasitos
• Pesquisador responsável: João Marcelo Pereira Alves
• Beneficiário: Davi Salles Xavier
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Genômica comparativa Interações hospedeiro-patógeno Proteínas da membrana Imunogenética
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Euglenozoa | Imunoinformática | Modos de Vida | Proteínas de Superfície | Genômica comparativa

Resumo

Entre os eucariotos, a composição proteica da superfície celular é altamente especializada para dar suporte a diferentes estilos de vida, participando da evasão imunológica, invasão celular, migração e interação ambiental. Essa mutabilidade e variação notórias podem ser exploradas através de análises comparativas em um grupo monofilético que apresente grande diversidade, correlacionando essas proteínas com diferentes modos de vida. O filo Euglenozoa possui uma amplitude de diferentes estilos de vida e se enquadra como um objeto de estudo em potencial para tais inferências evolutivas, sendo composto por organismos unicelulares de clados fotossintéticos, heterotróficos e numerosos exemplos de parasitismo. Considerando a importância das proteínas de superfície e sua interação com o microambiente, o projeto almeja identificar, analisar e comparar diferentes proteínas de superfície em Euglenozoa e sua distribuição em organismos com variados modos de vida, nos possibilitando inferências funcionais e sua correlação com diferentes habitats e comportamentos. Para tal, genomas e transcritomas representativos do filo Euglenozoa foram estrategicamente selecionados para abranger uma ampla diversidade e serão montados, preditos e anotados, quando necessário. As anotações metabólicas serão realizadas pelo programa ASGARD, que terá suas funcionalidades aperfeiçoadas nesse projeto e servirá para selecionar vias metabólicas associadas a proteínas de consulta. As análises filogenéticas serão realizadas utilizando inferências por Máxima Verossimilhança e Bayesiana, para as sequências de proteínas que foram preditas e anotadas como sendo de superfície. Adicionalmente, proteomas de organismos de interesse médico humano e veterinário em Euglenozoa, serão criteriosamente selecionados para a aplicação de estratégias de imunoinformática, utilizando as proteínas de superfície para a predição in silico de sequências potencialmente imunogênicas. (AU)