Genômica de Coronula diadema e Xenobalanus globicipitis e identificação de genes relacionados à associação ecológica entre cracas e cetáceos

• Processo: 22/14490-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2023
• Situação: Interrompido
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Sónia Cristina da Silva Andrade
• Beneficiário: Rafael Eiji Iwama
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 21/06738-8 - Genética de paisagens e genômica comparativa: uma abordagem integrada no estudo evolutivo de invertebrados marinhos, AP.BTA.JP2
• Bolsa(s) vinculada(s): 25/01088-6 - Caracterização da resposta imune inata contra vírus em cracas Balanus improvisus (Thecostraca: Thoracica) com ênfase em Vago., BE.EP.PD
• Assunto(s): Genômica comparativa Crustacea Cetacea Craca Ectoparasitoses Baleias Golfinhos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cracas | Epibiose | genômica comparada | Genômica comparada

Resumo

Epibiose é a relação ecológica em que um organismo usa outro como substrato, sem se alimentar dele. Várias espécies de cracas são epibiontes ou parasitas obrigatórios de organismos marinhos como os cetáceos, especialmente cracas da família Coronulidae. Nesta família, as espécies Coronula diadema e Xenobalanus globicipitis podem ser modelos no estudo de regiões gênicas relacionadas a adatação ao hábito epibionte e ectoparasita, especificamente na escolha do habitat. A comparação entre genomas de espécies epibiontes com espécies que se fixam em substratos fixos e enorgânicos é bastante informativa, possibilitando a identificação de regiões relacionadas à dependência de um substrato vivo, como a fixação ao substrato, estresse e tolerância à mudanças de habitat. Trabalhos dessa natureza são raros na literatura, fazendo deste um estudo pioneiro. Os objetivos do presente estudo são (i) sequenciar e anotar os genomas das espécies de cracas C. diadema e X. globicipitis, buscando genes que possam estar envolvidos com as relações ecológicas de epibiose e ectoparasitismo entre cracas, baleias e golfinhos. Serão conduzidas análises de gênomica comparada entre genomas montados neste projeto e genomas e transcriptomas de espécies de cracas fixas disponíveis em bancos de dados online (SRA-NCBI); (ii) identificar genes sob seleção positiva em C. diadema e X. globicipitis e apresetam codificam proteinas relacionadas a adaptação à vida em substratos móveis e (iii) sequenciar o genoma mitrocondrial de cracas das espécies C. diadema e X. globicipitis, e compará-los com genomas mitocondriais de cracas não epibiontes fixas em substratos imóveis, para identificar possíveis diferenças no DNA mitocondrial, como diferentes taxas metabólicas e alterações no número e disposição dos genes. (AU)