Dinâmica Molecular para Pesquisa de Tratamento Antiviral para Raiva

• Processo: 22/07128-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2023
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2025
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Saúde Coletiva - Epidemiologia
• Pesquisador responsável: Paulo Eduardo Brandão
• Beneficiário: Joana Rocha da Silveira Barreto de Aguiar
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia (FMVZ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Antivirais Simulação de dinâmica molecular Vírus Virologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: antiviral | ligands | molecular dynamics | Rabies | Virus | Virologia

Resumo

Raiva é uma zoonose que afeta principalmente populações pobres em países em desenvolvimento. Embora exista uma vacina eficaz contra a raiva, muitas pessoas nas áreas mais afetadas pela doença não estão cientes dos requisitos de vacinação e podem não conseguir chegar a uma área onde as vacinas estejam prontamente disponíveis. É possível que elas também não consigam pagar pela vacinação e imunoglobulina. Este projeto visa encontrar um tratamento potencial para a doença quando ela já atingiu seus estágios mais avançados, para que aqueles que não têm acesso à vacinação ainda tenham chance de sobreviver. Seguindo um projeto de mestrado focado em docking molecular para encontrar potenciais ligantes que possam atuar contra o vírus da raiva (RABV), este projeto trabalhará com outra ferramenta de bioinformática (dinâmica molecular) para estreitar ainda mais o campo de potenciais ligantes. A dinâmica molecular será utilizada para verificar como cada uma das cinco proteínas do RABV interage com ligantes que têm demonstrado potencial em inibir as proteínas através da ligação em docking molecular. Ao contrário do docking molecular, a dinâmica molecular vai um passo além nessa busca por tratamento, verificando as interações proteína-ligante em um ambiente que mais se assemelha a uma célula, pois permite ao usuário adicionar águas ao sistema e utilizar diferentes condições de temperatura, pressão e pH. Após a finalização da dinâmica molecular, serão realizados ensaios in vitro utilizando células N2A para verificar se esses ligantes podem inibir as proteínas do RABV.