Impacto de contaminantes na expressão gênica de comunidades microbianas do Estuário de Santos-São Vicente

• Processo: 23/00528-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2023
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2024
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia
• Pesquisador responsável: Gustavo Bueno Gregoracci
• Beneficiário: Natália de Oliveira Belido
• Instituição Sede: Instituto do Mar (IMar). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus Baixada Santista. Santos , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 20/15259-3 - Impacto de antibióticos, HPAs e metais na comunidade microbiana do sedimento do Estuário de Santos-São Vicente, AP.BTA.R
• Assunto(s): Microbiologia marinha
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Alinhamento de sequências | mRNA microbiano | Microbiologia marinha

Resumo

Poucas amostras de RNA de 2019 foram extraídas com sucesso pela falta de acondicionamento especial. Deverá auxiliar no enriquecemento de mRNA para preparo de bibliotecas. Durante o intervalo necessário ao sequenciamento, o bolsista acompanhará e executará atividades de análise de poluentes como metais e alguns HPAs das amostras. Análises dos antibióticos em si requererão validação experimental além do escopo deste bolsista, mas poderão ser apoiadas se possível. Recebendo as sequencias deverá realizar individualmente o controle de qualidade de cada, previamente à anotação. Penso em iniciar comanotação automática em servidor específico (MG-RAST) e dependendo do resultado partir para anotação específica distinta.Empregará parte dos dados de DNA do projeto para contrastar funções presentes no projeto com as funções expressas no cDNA, visando entender quais serviçoes ecossistêmicos estão sendo desempenhados nos locais. Os dados de expressão serão avaliados para inclusão na análise estatística por agrupamento. A interpretação desses dados requer boa base de microbiologia ambiental, ecologia e bioquímica, requerendo amplo estudo.