O uso da bioinformática em análises de metabarcoding direcionada ao ictioplâncton

• Processo: 23/04929-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2023
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2023
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Claudio de Oliveira
• Beneficiário: Cristina Bernardo
• Supervisor: Filipe José Oliveira Costa
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Universidade do Minho (UMinho), Portugal
• Vinculado à bolsa: 20/00538-4 - Identificação e caracterização da comunidade ictioplanctônica do estuário do Rio Ribeira de Iguape, São Paulo, Brasil, através de DNA metabarcoding, BP.DR
• Assunto(s): Biodiversidade Biologia computacional Conservação Evolução Ictioplâncton Identificação molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biodiversidade | Bioinformática | Conservação | DNA metabarcoding | Evolução | Ictioplâncton | identificação molecular | Taxonomia | DNA metabarcoding

Resumo

Os estuários são utilizados por muitos peixes como locais de reprodução, alimentação, desova e proteção contra predadores. O conhecimento das áreas de desova e recrutamento, bem como a identificação do ictioplâncton é essencial para entender a dinâmica populacional no ambiente, além de contribuir para a proteção da ictiofauna e gestão dos recursos pesqueiros. Visto que os métodos tradicionais de identificação de ovos e larvas apresentam limitações, técnicas moleculares, como o DNA barcoding, a qual utiliza marcadores específicos, possibilita a identificação de uma única espécie por análise. Sendo esta uma técnica vagarosa e de alto custo, o DNA metabarcoding, onde se sequenciam e identificam amostras de DNA em massa, tem se mostrado mais eficaz nesse processo de identificação de ovos e larvas. Em consequência da grande quantidade de dados produzidos nos trabalhos de DNA metabarcoding a bioinformática surge como uma ferramenta importante na identificação de sequências de DNA, gerando o maior número de informações biológicas e estatísticas em um curto espaço de tempo. Assim, o principal objetivo deste projeto é o aprendizado e utilização de técnicas de bioinformática, que são fundamentais na análise dos dados de metabarcoding e por conseguinte, gerar informações relevantes para futuros planos de manejo e conservação de áreas prioritárias para a manutenção dos peixes no estuário do Rio Ribeira de Iguape - SP. Além disso o desenvolvimento do presente trabalho no laboratório do Dr. Filipe Costa irá estreitar os laços de cooperação entre nossos laboratórios. (AU)