Integração de metodologias multiômicas para desvendar o panorama molecular dos sarcomas ósseos

• Processo: 23/12984-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 05 de dezembro de 2023
• Data de Término da vigência: 04 de novembro de 2024
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Mariana Camargo Maschietto
• Beneficiário: Felipe Luz Torres Silva
• Supervisor: Sam Behjati
• Instituição Sede: Centro Infantil de Investigações Hematológicas Dr Domingos A Boldrini (CIB). Campinas , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Wellcome Sanger Institute (WSI), Inglaterra
• Vinculado à bolsa: 22/04781-6 - Busca dos mecanismos moleculares envolvidos com a tumorigênese de tumores ósseos, BP.DD
• Assunto(s): Biologia computacional Análises multiômicas Transcriptoma Sarcoma de Ewing Neoplasias ósseas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bone tumors | Methylome | Multiomics | Single-Cell RNASeq | transcriptome | whole exome sequencing | Bioinformática

Resumo

Os tumores ósseos incluem osteossarcomas (50%) e sarcomas de Ewing (40%) e outros sarcomas mais raros, todos apresentando altas taxas de morbidade e mortalidade. Com a introdução dos estudos do metiloma, os sarcomas podem ser classificados com base em seus perfis de metiloma e os estudos de coorte em andamento tentam correlacionar a classificação molecular com o desfecho do paciente. Cada histologia apresenta um perfil molecular característico: os sarcomas de Ewing apresentam rearranjos estruturais envolvendo genes da família EWS e FLI1 ou ERG, os sarcomas Ewing-Like apresentam rearranjos envolvendo CIC ou BCOR e os osteossarcomas apresentam uma alta carga mutacional com poucos genes mutados recorrentemente. Tanto a metilação quanto a mutação do DNA (incluindo rearranjos cromossômicos) interferem no transcriptoma celular e são necessárias para a transformação celular. A identificação de vias comuns e específicas para cada tipo de tumor ósseo apontará para a célula de origem, que não é conhecida para esses sarcomas. O objetivo deste estudo é desvendar as alterações moleculares subjacentes à progressão dos tumores ósseos, analisando o metiloma do DNA, o sequenciamento completo do exoma e do transcriptoma, bem como integrando dados das metodologias multiômicas. (AU)