Usando o sequenciamento do genoma completo do lagarto verde Enyalius iheringii para investigar a base genômica da adaptação ambiental ao longo da Mata Atlântica

• Processo: 23/16814-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 17 de julho de 2024
• Data de Término da vigência: 16 de julho de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Zoologia - Zoologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Miguel Trefaut Urbano Rodrigues
• Beneficiário: Mariana Mira Vasconcellos
• Supervisor: Hannes Svardal
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University Of Antwerp, Bélgica
• Vinculado à bolsa: 19/08308-0 - Demografia histórica comparada e respostas `as mudanças climáticas passadas na mata atlântica: mudanças populacionais e adaptação local, BP.PD
• Assunto(s): Análise de sequência de DNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Adaptação climática | Associação genoma-ambiente | Enyalius iheringii | genômica adaptativa | Lepidosauria | Sequenciamento genomico | Genômica da Conservação

Resumo

Esta proposta de pesquisa tem como objetivo desvendar a base genômica da adaptação ambiental do lagarto verde (Enyalius iheringii) ao longo da Mata Atlântica, um hotspot de biodiversidade na América do Sul. O projeto concentra-se na geração de um genoma de referência de alta qualidade, em nível de cromossomal, para E. iheringii e na utilização de ferramentas genômicas para caracterizar a variação genômica espacial em sua distribuição. Ao empregar uma abordagem de associação genoma-ambiente, o estudo visa identificar loci adaptativos associados à variação climática ao longo do acentuado gradiente latitudinal da Mata Atlântica. Análises genéticas populacionais, incluindo dados de RADseq e genômica da paisagem, fornecerão insights sobre o fluxo gênico e a dinâmica de adaptação local. Adicionalmente, análises de enriquecimento de ontologia gênica inferirão a importância funcional dos loci adaptativos identificados. Os resultados esperados incluem uma compreensão abrangente da paisagem genômica adaptativa na Mata Atlântica e o desenvolvimento de valiosos recursos genômicos para esforços de conservação. Este projeto, conduzido em colaboração com o Dr. Hannes Svardal na Universidade da Antuérpia, se beneficiará da experiência do laboratório anfitrião em montagem de genomas completos e genômica evolutiva de vertebrados, contribuindo para o campo da genômica da conservação da Mata Atlântica.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

FRENCH, CONNOR; DAMASCENO, ROBERTA; VASCONCELLOS, MARIANA; RODRIGUES, MIGUEL; CARNAVAL, ANA; HICKERSON, MICHAEL. Elevational Range Impacts Connectivity and Predicted Deme Sizes From Models of Habitat Suitability. Molecular Ecology, v. 34, n. 1, p. 18-pg., 2024-11-21. (13/22477-3, 11/50146-6, 19/08308-0, 15/11498-5, 23/16814-9)